Форум 3DNews
Вернуться   Форум 3DNews > Разное > Флейм > Тематический околокомпьютерный флейм

Ответ Создать новую тему
Опции темы Опции просмотра
Непрочитано 06.06.2020, 14:35   [включить плавающее окно]   #381
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Гонку за терафлопсами пора заканчивать

Гонку за терафлопсами пора заканчивать
Александр Андреев, сайт BOINC.RU

Вот уже в третий раз российские специалисты, работающие в области высокопроизводительных вычислений, завершили год в красивом старинном городе Переславле-Залесском, где в конце 2014 года на базе Института программных систем имени А.К. Айламазяна РАН [1] прошел Третий национальный суперкомпьютерный форум [2].

Мне довелось поучаствовать в работе как этого, так и прошлогоднего, Второго форума (о нем см. [3]). Есть с чем сравнивать. И в этом году можно было заметить существенные отличия как в целом, так и в работе, интересующей меня секции. Во-первых, программа форума расширилась за счет проведения двух дополнительных мероприятий: научно-практической конференции «Посткремниевые вычисления» и мини-симпозиума «Прикладная математика в эпоху суперкомпьютеров». Во-вторых, несмотря на некоторое снижение числа участников (449 в 2013 году и 300 в 2014-м), выросло количество докладов на форуме (127 против 110). Изменилась и тематика докладов, которая сместилась от вопросов проектирования суперкомпьютеров к более прикладным вопросам применения высокопроизводительных вычислений в различных областях науки, техники и производства.

В-третьих, форум от формата обычной площадки для обмена мнениями и информацией перешел к непосредственной поддержке исследований в области высокопроизводительных суперкомпьютерных вычислений, учредив собственную отраслевую премию, которая так и называется — премия Национального суперкомпьютерного форума. Ближе к следующему форуму в результате заочного тайного голосования среди специалистов отрасли будет определено 30 участников второго тура. И уже в ходе проведения НСКФ-2015 тайным рейтинговым голосованием изберут трех лауреатов премии.

В-четвертых, на форуме неоднократно и явно прозвучало, что гонку за «попугаями» в виде гига- и терафлопсов пора заканчивать. Конечно, сравнивать различные суперкомпьютерные системы каким-то образом нужно, но это сравнение должно базироваться на основе не искусственных тестов, а реальных задач и приложений, решаемых на высокопроизводительных системах.

Традиционным для форума осталось широкое представительство научных и производственных организаций, занимающихся созданием и исследованием суперкомпьютерных систем.

Уже второй год на форуме была представлена и такая специфичная технология высокопроизводительных вычислений, как грид-системы из персональных компьютеров. Причем в этом году кроме секционных были представлены и два пленарных доклада. С одним из них — «Концепция многозадачной грид-системы с гибким управлением свободными вычислительными ресурсами суперкомпьютеров» —выступил директор Института динамики систем и теории управления СО РАН, академик РАН Игорь Бычков [5].

В целом от Третьего национального суперкомпьютерного форума осталось двойственное впечатление. С одной стороны, явно видно, что в области программных и конечных аппаратных высокопроизводительных систем в нашей стране есть интересные и конкурентоспособные разработки, с другой — все они базируются на импортных составляющих и комплектующих, которым в настоящее время нет отечественной замены. И здесь перед нашей наукой и производством имеется огромный как социальный, так и политический заказ. Хотелось бы увидеть положительные тенденции в развитии именно этого направления.

Будущее персональных грид-систем

Публикуем также комментарии экспертов о роли и месте грид-систем, основанных на использовании персональных компьютеров.
МихаилПосыпкин, вед. науч. сотр. Центра распределенных вычислений ИППИ РАН, председатель Российского отделения IDGF:

Многих, вероятно, может удивить то, что на мероприятии, посвященном суперкомпьютерным вычислениям, поднимается тема организации высокопроизводительных расчетов с использованием персональных компьютеров. Однако это не случайно. Нередки случаи, когда на суперкомпьютерах решаются задачи, не требующие интенсивного обмена данными. При этом дорогостоящее сетевое оборудование («интерконнект») кластеров фактически не используется.

Подобные задачи целесообразно решать на более дешевых ресурсах, таких как, например, грид-системы персональных компьютеров. Развитием и популяризацией этой технологии мы и пытаемся заниматься.
Несмотря на то что мы участвуем в Национальном суперкомпьютерном форуме уже во второй раз и на этот раз кроме проведения секции нам дали возможность выступить с двумя пленарными докладами, есть ощущение, что представители научной сферы вообще и суперкомпьютерной отрасли в частности недооценивают возможности распределенных вычислений на базе персональных компьютеров. Причиной этого, на наш взгляд, является недостаточная информированность о существовании и особенностях подобной технологии.

В этой связи хотелось бы упомянуть, что в ЦЕРНе, имеющем как собственные огромные вычислительные ресурсы, так и доступ ко многим мировым суперкомпьютерным центрам, тем не менее не только продолжают, но и расширяют использование персональных грид-систем. И более того, у них запущено уже три проекта добровольных распределенных вычислений как для решения технических вопросов функционирования Большого адронногоколлайдера, так и для моделирования и обработки данных конкретных физических экспериментов.

На наш взгляд, тормозит внедрение этой удобной технологии и боязнь специалистов-предметников вникать в тонкости информационных технологий, разбираться с работой серверного и клиентского ПО. Поэтому на круглом столе, прошедшем в рамках секционной работы форума, было решено заняться организацией «BOINC-инкубатора», постаравшись организовать поиск потенциально перспективных идей, способных быть решенными в рамках этой компьютерной технологии и максимально облегчить реализацию таких проектов.

С этой целью отобранным в ходе предстоящего конкурса проектам будет оказана серьезная техническая помощь в виде предоставления вычислительных ресурсов и консультационной помощи высококвалифицированных специалистов по адаптации имеющегося расчетного приложения для работы в рамках персонального грида. В результате, как ожидается, будет существенно снижена «стоимость входного билета» в мир высокопроизводительных грид-технологий на базе персональных компьютеров.

Кроме того, на этом форуме был представлен доклад, в котором мы попытались показать, как грид-системы из персональных компьютеров можно успешно интегрировать с суперкомпьютерами, создавая мощные комбинированные распределенные комплексы. Одним из инструментов для такой интеграции может служить совместная разработка команд из Института динамики систем и теории Управления СО РАН и ИППИ РАН — система CluBoRun (Clusterfor BOINC Run). Достоинством данной системы является то, что она может использовать простаивающие ресурсы суперкомпьютеров, которые неизбежно образуются при использовании систем пакетной обработки, применяемых на кластерах коллективного доступа.

Хотел бы еще сказать, что Российское отделение IDGF (Международной федерации грид-систем из персональных компьютеров) стало официальным членом Национальной суперкомпьютерной технологической платформы (НСТП). Это открывает нам доступ к информационным ресурсам платформы и позволяет использовать площадку НСТП для налаживания эффективного взаимодействия с представителями российской суперкомпьютерной отрасли.

Олег Заикин, науч. сотр. ИДСТУ СО РАН, координатор проекта SAT@home и один из создателей CluBoRun:

Хотел бы прежде всего поддержать высказанную Михаилом мысль о том, что необходимо помогать заинтересованным исследователям в освоении технологии персональных грид-систем и, возможно, в создании и развитии добровольных проектов. Действенность такой поддержки показывает пример нашего проекта SAT@home, работающего уже более трех лет. И на начальном этапе, и даже сейчас большую помощь нам оказывают специалисты Центра распределенных вычислений ИППИ РАН. Собственно, и сам сервер проекта с самого начала работы и до настоящего момента находится на их площадке. Не могу не сказать о той помощи, которую нашему проекту оказывают и добровольные помощники — волонтеры-кранчеры. Причем некоторые из них превратились в реальных помощников в развитии проекта, вошли в команду разработчиков. Один из них, Максим Манзюк, стал одним из основных создателей программы CluBo-Run и полноправным соавтором доклада, с которым выступал на НСКФ И.В. Бычков.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/
Миниатюры
Нажмите на изображение для увеличения
Название: 12528258493_e7973e1dda_b.jpg
Просмотров: 30
Размер:	179.3 Кб
ID:	57652  
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 12.06.2020, 16:02   [включить плавающее окно]   #382
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты — 2
Об авторах
Тимур Исмаилович Маджидов — кандидат химических наук, старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории хемоинформатики и молекулярного моделирования Химического института имени А. М. Бутлерова Казанского федерального университета. Область научных интересов — хемоинформатика, квантовая и вычислительная химия, большие данные в химии, использование методов машинного обучения и искусственного интеллекта в химии.
Георгий Фёдорович Куракин — ординатор кафедры биохимии с курсом клинической лабораторной диагностики Тверского государственного медицинского университета. Область научных интересов — биохимия, молекулярная биология, биоинформатика, хемоинформатика. Лауреат конкурса «Био/мол/текст-2019».
https://elementy.ru/nauchno-populyar...ye_rezultaty_2
https://elementy.ru/nauchno-populyar...ye_rezultaty_2
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 13.06.2020, 08:28   [включить плавающее окно]   #383
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
«BOINC» – поиск лекарств от СПИДа мобильным телефоном.

«BOINC» – поиск лекарств от СПИДа мобильным телефоном.

Распределённые вычисления (решение трудоёмких вычислительных задач с использованием нескольких компьютеров) — способ, используемый уже сорок лет для относительно быстрого произведения расчётов, которые иначе даже на современных компьютерах заняли бы сотни лет. На днях же стало возможно участвовать в поиске лекарств от СПИДа с помощью обычного мобильного телефона, работающего с операционной системой Android.

Последние двадцать лет в распределенных вычислениях могут принимать участие добровольцы, интересующиеся самыми разными вещами — от решения математических задач до поиска внеземных цивилизаций и лекарств от рака.

Для того, чтобы принять участие в поиске лекарств от СПИДа достаточно установить мобильное приложение и зарегистрироваться в системе World Community Grid, анонсировавшей новшество; после этого владельцу телефона делать ничего не надо.

В будущем планируется создание приложений и для других мобильных систем, и для других проектов добровольных вычислений — ведь чем больше людей примет участие, тем быстрее будут решены касающееся всего человечества вопросы; при этом, конечно, все желающие по-прежнему смогут установить программу для вычислений на персональном компьютере. Создатели приложения говорят, что идея порождена самим фактом развития индустрии мобильных телефонов: при появлении WCG в 2004 году компьютеры обладали меньшей вычислительной мощностью, чем многие современные смартфоны.

При этом авторы приложения помнят о том, что мобильный телефон создан, в первую очередь, для связи и обещают не разряжать его: по умолчанию приложение работает только тогда, когда мобильный телефон поставлен на зарядку, а данные передаются, если телефон соединён с Wi-Fi сетью.

Проект по поиску лекарств от СПИДа, FightAIDS@Home, существует с ноября 2005 года, и проводится сообществом WCG совместно с лабораторией ОлсонTheScrippsResearchInstitute. Задача проекта — поиск среди миллионов химических соединений вещества, способного блокировать вирусную протеазу, чтобы сделать невозможным размножение вируса.

Используемая на персональных компьютерах программа BOINC распространяется под свободной лицензией LGPL, а доктор Алекс Л. Перриман предоставляет по запросу результаты всех полученных с помощью добровольных вычислений экспериментов — правда, запросившему потребуется использовать для получения этих данных несколько жёстких дисков.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/
Нажмите на изображение для увеличения
Название: Слайд1.JPG
Просмотров: 35
Размер:	158.0 Кб
ID:	57681
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 20.06.2020, 07:59   [включить плавающее окно]   #384
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Исследования структуры белка в проекте CAS@home

Исследования структуры белка в проекте CAS@home

Область исследований: структура белка
Институт: Институт вычислительных технологий, CAS
Применение: TreeThreader

Введение

Понимание структур и взаимодействий белков необходимо для понимания их механизмов и, следовательно, необходимо для полного понимания жизненных процессов на молекулярном уровне. В настоящее время более семи миллионов случаев белка достигают точности ЯМР среднего разрешения, или последовательности помещаются в базу данных UniProtKB / TrEMBL, но только 50000 из них имеют экспериментально решенные структуры. Высокий спрос сообщества на белковые структуры поставил компьютерное прогнозирование белковой структуры, на беспрецедентно важную позицию.

Однако для предсказания структуры белка требуется огромное вычислительное время. Например, многопоточность, ведущий метод прогнозирования структуры белка, занимает очень много времени, поскольку последовательность запросов должна быть выровнена по всему шаблону в базе данных. Работа на добровольных началах - это просто отличный шанс для предсказания структуры белка.

Наша цель - разработать новую практическую программу потоков, которая может учитывать парное взаимодействие. Доказано, что общий случай (рассматриваются все парные контакты) задачи NP-труден. Итак, мы обратимся к использованию вложенного графа для описания частей контактов шаблона (так же, как ковариационная модель для анализа вторичной структуры РНК), что может быть выведено с точки зрения вычислительной эффективности.

Учитывая шаблон T и последовательность запросов S, структура программы выглядит следующим образом:

Представлять шаблон несколькими вложенными графиками.
Здесь мы используем итеративный алгоритм для решения этой проблемы, в каждом раунде используем динамическое программирование для построения оптимального вложенного графа и удаляем все содержащиеся в нем контакты из исходного графа контактов.

Выровняйте каждый вложенный граф с последовательностью запросов.
Мы используем CRF (условные случайные поля) для моделирования этой проблемы. CRF - это вероятностная модель, и ее можно легко добавить.
Объединить выравнивания вместе.

Каждый вложенный граф даст выравнивание между шаблоном и запросом. Мы можем объединить их в одно выравнивание на уровне апостериорной матрицы вероятностей, используя технику вероятностной согласованности, или построить окончательную модель независимо, используя MODELLER, и затем выбрать лучшую.

Прогресс

Спасибо всем вам! Мы завершили первую версию TreeThreader. Хотя контактная информация о дальнем расстоянии еще не рассматривается, эта версия имеет сопоставимые характеристики по сравнению с современными методами, такими как HHpred.

Мы рассмотрим дальнейшие контакты и учтем эту информацию в нашей следующей версии TreeThreader. Кроме того, наш TreeThreader принял участие в CASP10 (Эксперимент в сообществе, по критической оценке, методов прогнозирования структуры белка), одном из конкурсов прогнозирования структуры, в котором тестируется большинство современных методов. Мы сообщим о нашей работе в CASP10, как только будут опубликованы официальные результаты CASP10.
Моделирование молекулярной динамики

Введение

LAMMPS - это пакет моделирования молекулярной динамики с открытым исходным кодом, распространяемый SandiaNationalLaboratories.
Благодаря CAS @ Home, исследовательская группа в CNMM, Университет Цинхуа, использует универсальный интерфейс передачи заданий LAMMPS для запуска нескольких различных проектов, которые требуют крупномасштабного моделирования молекулярной динамики.

Первый проект LAMMPS, который будет запущен подобным образом CNMM, направлен на выполнение атомистического моделирования для изучения диффузии и транспорта молекулярного газа через наноразмерные каналы. Исследователи этого проекта - Ю Ван и Йозеф Эллингсен, главный исследователь - ЧжипинСюй.

Мотивация этого исследования заключается в разработке высокоэффективной и недорогой фильтрации для удаления летучих органических соединений (ЛОС) из азота и кислорода. Другими словами, это фундаментальное исследование новых способов фильтрации потенциально опасных химических веществ из воздуха, которым мы дышим.

Исследуемые фильтры основаны на иерархических сетях с участием наноструктурированных материалов. Расчеты, выполненные добровольцами, при статистическом анализе могут обеспечить профили свободной энергии для молекулярной диффузии.
Интерфейс передачи заданий LAMMPS / BOINC, используемый в этих исследованиях, разработан в сотрудничестве между Институтом физики высоких энергий, CAS, Лабораторией космических наук, Калифорнийский университет в Беркли, и CNMM, Университет Цинхуа. Интерфейс LAMMPS / BOINC доступен для других ученых для использования и адаптации для собственных исследований. Для получения дополнительной информации, пожалуйста, свяжитесь с CAS@home.

Пекинский электронный позитронный коллайдер
Введение

BES является детектором общего назначения, работающим на BEPC (Пекинский электронный позитронный коллайдер), и был запущен в строй в 1984 году, а производство - в 1989 году. Основные обновления были применены как на BEPC, так и на BES в период с 1995 по 1998 год, следовательно, BEPC обновлен до BEPCII, и BES является BESII и BESIII. BESIII - текущий детектор, работающий на BEPCII. BES - это первая экспериментальная установка для физики элементарных частиц, разработанная и реализованная в самом Китае и включающая несколько субдетекторов. Как детектор, BES составляет около 6 м в длину, 7 м по высоте и ширине и весит около 500 тонн. BESIII применяет множество передовых технологий детекторов из разных стран мира и подобен «глазу» BEPCII для захвата и измерения субчастиц, образующихся при столкновениях e + и e-, для изучения основной единицы и взаимодействия между частицами вещества на уровень микроструктуры. BESIII является единственным в мире детектором, который работает в области энергий от 2 до 5Gev, и около 200 физиков из 27 мировых исследовательских институтов присоединились к сотрудничеству BESIII для проведения исследований по физическим теориям, таким как сильные взаимодействия и слабые взаимодействия в области энергии Тау-Шарм.
Как и в других расчетах HEP-эксперимента, для BESIII обычно существует 3 вида вычислений:

Имитационные вычисления (также называемые вычислениями Монте-Карло): для имитации столкновений, происходящих внутри детектора.
Реконструкция вычислений: передача необработанных данных, полученных с детектора или сгенерированных с помощью моделирования, в данные с физическим значением.
Анализ Вычисления: Тест против физических теорий, основанных на восстановленных данных.

Среди всех этих 3-х вычислений BESIII SimulationComputing является наиболее подходящим для волонтерских вычислений, потому что для этого требуются очень ограниченные входные данные. Однако программное обеспечение, которое используется для запуска BESIII-моделирования (BOSS, BES OfflineSoftware), очень зависит от платформы, поэтому для выполнения заданий BESIII-вычислений в BOINC необходимо использовать технологии виртуальных машин.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/
Нажмите на изображение для увеличения
Название: 1_6922460.jpg
Просмотров: 36
Размер:	9.4 Кб
ID:	57688

Нажмите на изображение для увеличения
Название: maxresdefault.jpg
Просмотров: 45
Размер:	67.1 Кб
ID:	57689
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 21.06.2020, 10:05   [включить плавающее окно]   #385
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Попали в SETI: добровольные вычисления для скептиков, оптимистов и искушенных кранчер

Попали в SETI: добровольные вычисления для скептиков, оптимистов и искушенных кранчеров

СПОЙЛЕР »
Попали в SETI: добровольные вычисления для скептиков, оптимистов и искушенных кранчеров
10 юня 2020 Научно-популярное

Природа настолько очистилась, что на набережную реки Мойки в Санкт-Петербурге вернулись бобры, а к проектам добровольных распределенных вычислений — интерес общества. В этом тексте, однако, вы не увидите описания всем известных инициатив volunteer computing.

Технический писатель Selectel Ульяна Малышева поговорила с руководителями нескольких проектов распределенных вычислений, кранчерами (так называют волонтеров) и даже админом российского сайта BOINC. Что привлекает, а что отталкивает в подобном волонтерстве? Почему «золотой век» добровольных вычислений в России завершился в 2010 году? О каких проектах вы можете не знать, даже если давно в «теме»? Ответы — под катом.
Для тех, кто не знаком с основными понятиями добровольных распределенных вычислений, мы составили мини-словарь кранчера. Если же вы опытный, ждем в комментариях. Поделитесь своей историей и мнением: видите ли вы смысл в таком волонтерстве?

В 2020 году коронавирус вызвал новую волну интереса к добровольным распределенным вычислениям. Проект Folding@home, который на данный момент занимается исследованием SARS-CoV-2 (COVID-19), по суммарной производительности обошел все суперкомпьютеры, входящие в топ-500 по миру.

По состоянию на май он «насобирал» мощностей на 2,3 экзафлопса — в проект вкладывались и волонтеры, и компании. VMware не только выделил проекту вычислительные ресурсы, но и позволил подключаться к Folding@Home через платформу vSphere. А Selectel пожертвовал мощности серверов с графическими ускорителями NVIDIA GeForce GTX 1080.

К слову, первый в мире экзафлопсный компьютер должен был появиться в 2021 году. Компания Intel обещала построить машину, производительность которой составит квинтиллион операций в секунду. В итоге мощнее распределенного «компьютера», собранного Folding@home буквально по флопсам, похоже, он уже не станет.

Причины успеха

Folding@home можно назвать феноменом среди проектов добровольных вычислений. Многие из них довольствуются лишь несколькими терафлопсами «внимания». Причин такого успеха несколько.

Понятная и актуальная проблема. Коронавирус коснулся всех. Нередко проекты той же платформы BOINC критикуют за неясность исследовательской цели и сложно переносимый на жизнь результат.

Распространение информации в СМИ. Среди проектов добровольных вычислений есть звезды — SETI@home, Rosetta@home, Einstein@home. Вместе с тем, до 80-85% других инициатив не выходят за рамки форумов и своих страниц на сайте BOINC.

Информирование о результатах. Folding@home постоянно на связи с волонтерами, ученые готовы рассказывать о проделанной работе. Отсутствие новостей о проекте — одна из причин охлаждения волонтеров к добровольным вычислениям.

Кроссплатформенность. Клиент Folding@home можно скачать для Windows, macOS и целого ряда дистрибутивов Linux.

С еще двумя частыми причинами скептического отношения к добровольным вычислениям Folding@home не справляется. Однако их нивелирует социальный вес проекта.

Нет гарантии получения результата (либо он будет спустя долгое время). Действительно, многие проекты добровольных вычислений существуют больше десяти лет. Но за эти годы произошло очень мало реальных достижений, понятных людям.

Александр Андреев, администратор российского сайта BOINC

Люди хотят впечатляющих результатов. Руководители SETI@home не обнаружили инопланетян, а инициаторы Rosetta@home не открыли универсальную вакцину. Это становится аргументом в пользу признания проектов добровольных вычислений неэффективными. Но важно понимать, что наука — это про маленькие шаги и неочевидные открытия. Например, в ходе работы Einstein@home ученые гравитационные волны не зафиксировали, но как побочный эффект научились открывать новые пульсары. А расчеты проекта LHC@home серьезно помогали работе Большого адронного коллайдера (БАК). Любые промежуточные результаты проектов идут в работу, становятся частью научных публикаций. Просто, к сожалению, не все проекты находят время нас об этом уведомлять.

Значительный расход энергии. Добровольные вычисления также ругают за экономическую нерентабельность. Часто проекты рекомендуют жертвовать мощности GPU — в таких случаях work unit считается быстрее, но и энергии потребляет немало. Этот пункт, однако, становится более раздражающим, когда волонтеры теряют стимул участия в проектах.

Ответ скептикам

По данным, актуальным на 9 июня 2020 года, число активных участников платформы BOINС составляет 105 790 человек, к работе подключены 727 784 компьютера. Только за один этот день к сообществу присоединились более 70 новых добровольцев.

Участие в проектах добровольных вычислений — это не всегда про рациональность. Опросив кранчеров, выяснили, что обычно мотивирует присоединяться к инициативам, несмотря на некоторые их очевидные минусы.

Ощущение вклада в развитие науки

Участие в проектах дает чувство причастности к решению сложной проблемы человечества — будь то математическая задача или вызов с большим социальным выхлопом.

Дмитрий Кострюков, старший системный инженер Selectel, опыт кранчера — 9 лет

Я присоединился к BOINC примерно 9 лет назад — подключил не только ПК, но и мобильный телефон. Тогда выбрал Folding@home и Rosetta@home. Мотивировала сама идея добровольных распределенных вычислений. С минимальными затратами, буквально «с миру по нитке», можно решать научные задачи, которые в будущем улучшат жизнь человечества. Также меня раздражала мысль, что у меня в распоряжении есть крутая технология — ноутбук. Но нередко его силы уходят на запуск Chrome и загрузку Google Sheets. Хотелось придать большую ценность технологиям, зашитым в современных гаджетах. Ведь раньше на гораздо менее мощных процессорах рассчитывали полеты в космос и «640 Кб хватало всем».

Получение личных бонусов и признания

Активные (да и пассивные) участники получают сертификаты, подтверждающие их вклад в науку. Также большинство проектов награждают кранчеров бейджами в зависимости от количества «вложений» человека в проект и результатов этой помощи. Любой участник может попасть в проектный топ и стать «пользователем дня». Также существует кросс-проектный некомандный рейтинг, попасть в который — особая честь.

Наталия Никитина, научный сотрудник лаборатории телекоммуникационных систем Института прикладных математических исследований КарНЦ РАН, руководитель RakeSearch (BOINC)

Все участники проекта автоматически попадают в общий рейтинг, ранжируемый по количеству вложенных мощностей. Такие топы — стандартный для сообщества BOINC формат. Все личные достижения сохраняются навсегда, что также важно для многих людей в сообществе. Люди видят, что есть самые разнообразные вычислительные задачи, что их можно успешно решать по определенными алгоритмам. Даже небольшой вклад имеет значение и может привести к удачному результату. Хозяева компьютеров, на которых были сделаны маленькие, но значимые открытия, награждаются бейджами (каждый месяц разными).
Причастность к сообществу, рейтинги и гонка за кредитами

На платформе BOINC устраивают и челленджи, и целые чемпионаты. Ежегодно на ней проводится личная «Формула-1» для кранчеров — Формула BOINС, где команды соревнуются по количеству мощностей, вложенных в проекты.

Чемпионат состоит из марафона и спринтов. Марафон учитывает очки, полученные за все виды участия команд в проектах BOINC. Спринты подразумевают под собой концентрацию команд на одном проекте, о котором сообщают за 24 часа до старта спринта. Таким образом, платформа привлекает внимание сообщества ко всем инициативам, а не только к тем, в которых выгодно участвовать.

На BOINC есть и несколько команд из России. Одна из самых крупных — Russia Team. Сейчас в ее составе 2 388 участников, из них активных — 164. Группа российских кранчеров занимает 32 место в рейтинге, учитывающем более 100 000 команд со всего мира.

Александр Андреев, администратор российского сайта BOINC

В «золотое время» распределенных вычислений в России — это примерно «нулевые» годы — создание команды было событием. Звучали планы о формировании национальной «сборной». Мы выстраивали тактику, чтобы вырваться в лидеры. Каждая уважающая себя команда имела свой сайт и форум. Конечно, всегда находятся те, кто считает, что такие соревнования ¬— это антинаучно, что они подрывают саму идею добровольных вычислений. С другой стороны, состоять в какой-то группе (в играх — это гильдия, клан) — естественная социальная потребность человека.

Никита Кунец, системный администратор Selectel, опыт кранчера — 4 года

Для кого-то такие элементы геймификации являются дополнительной мотивацией для участия в проектах, использующих добровольные вычисления. Лично я год назад решил, что для меня это не главное. И направил свои ресурсы в проект Science United, который агрегирует исследования в разных научных областях. Там нет кредитов, бейджей и рейтинга. Люди просто вкладываются, потому что могут и хотят.

Количество участников из России, которые когда-либо подключались к проектам BOINC, на момент написания текста составляет 52 547 человек. Это примерно 0,4 % от общего населения страны. Действующих участников и того меньше — этот показатель держится на уровне 1300-1400 человек. Мировая BOINC-позиция РФ на основе RAC — 33 (из 277 стран, представленных на платформе).

Очевидно, что такое волонтерство — не для всех. Более того, начинающие кранчеры нередко испытывают быстрый спад мотивации: скачали ПО, неделю «погоняли» задачи и закрыли историю.

Как не перегореть на старте и справиться с распространенными проблемами «новичков»? Составили список советов вместе с опытными волонтерами.
1. Готовьтесь к тому, что первый пользовательский опыт может быть ужасен. Перед вами перечень проектов, вы не понимаете, как в них участвовать, а их странички, кажется, не обновлялись с момента открытия платформы BOINC не отличаются приятным интерфейсом. К этому привыкаешь, когда сосредотачиваешься на пользе, которую можешь принести обществу.
2. Адаптироваться на платформе помогут сайты-агрегаторы, где представлены сразу несколько исследований из разных областей науки. Вы сможете выбрать себе один-два проекта по душе и не тратить время на изучение всех существующих инициатив.
3. Оцените свои возможности. Если вы запускаете вычисления всего на 30 минут в день, вы особо никому не поможете. Этого времени слишком мало, чтобы компьютер успел завершить поставленную проектом задачу. Промежуточные результаты не учитываются и не сохраняются. Если вы получили work unit, но компьютер не справился с расчетами за выделенное время, считайте, ваш процессор прогрел воздух впустую. Незавершенная задача просто передается другому пользователю, причем все вычисления производятся заново.
4. Выбирая проекты, обратите внимание на менее крупные. Folding@home и Rosetta@home, например, у всех на слуху. Но количество задач даже у них ограничено — вам может просто не приходить работа или приходить редко.
5. На первых порах ваш счетчик кредитов может расти слабо. Не разочаровывайтесь и не отказывайтесь от волонтерства. Отнеситесь к этому как к долгосрочной инвестиции, пробуйте разные проекты. В какой-то момент вы найдете для себя идеальную формулу «контрибуции» ресурсов и будете радоваться маленьким победам.
6. Если у домашнего ПК есть видеокарта NVIDIA, некоторые проекты могут работать на ней и вычислять намного быстрее. Еще и отапливать комнату зимой.
7. Шутки шутками, но, если ваш компьютер сильно греется, подумайте об оптимизации. По умолчанию тот же BOINC будет использовать ЦПУ на 100%. Но в настройках клиента вы можете снизить это значение, например, до более комфортных 80%. Также убедитесь, что дали разрешение на работу приложения только на время простоя процессора.
8. Хороший вариант — запускать компьютер на ночь и идти спать. Лучший — купить виртуальную машину у облачного провайдера и запустить там BOINC 24/7.
9.
Никита Кунец, системный администратор Selectel, опыт кранчера — 4 года

У меня поднято три хоста в Облачной платформе исключительно для вычислений BOINC. Так может сделать любой: поднять хост (даже с минимальными характеристиками 1 CPU, 2 GB RAM, 10 GB HDD), например, на Облачной платформе Selectel, и считать задачи там. Отмечу, правда, что при 1 CPU задачи будут обрабатываться не очень быстро. Настраивать работу BOINC в облаке будет чуть сложнее. В качестве инструкции рекомендую эту статью на Arch Wiki.

Андрей Крюков, сотрудник отдела разработки и сопровождения VMware в Selectel

Мой CPU перегревался от нагрузки — AMD Ryzen 7 3700x нагревался до ~90 градусов. Как следствие — раздражающий шум системы охлаждения. Но у меня компактный корпус ПК, и компоненты я подбирал не для постоянной нагрузки. Когда задействовал графический процессор для вычислений, проблема с перегревом решилась — компьютер работал на штатных 70-75 градусах.
Как вычислить свой проект

Вы всегда можете зайти на сайт BOINC и выбрать любой проект, который вам покажется интересным. В таком случае обычно выигрывают инициативы, о которых пишут в СМИ, либо те, которые занимаются понятными вещами — прогнозом погоды, изучением болезней, поиском лекарств и так далее. Поэтому мы решили больше рассказать о проектах, которым не достается такого внимания.

Made in Russia

На платформе BOINC есть два проекта, инициированных российскими учеными. Оба посвящены вопросам математики. Руководители проектов рассказали, зачем им нужны мощности и каких результатов они добились благодаря волонтерам.

Gerasim@home

Чем занимается:
1. Решением задач дискретной оптимизации (поиск наиболее эффективных эвристических методов);
2. Исследованием свойств диагональных латинских квадратов.

Эдуард Ватутин, доцент Юго-Западного государственного университета (кафедра вычислительной техники), научный руководитель проекта Gerasim@home

За годы реализации проекта волонтеры «посчитали» более 20 числовых рядов, связанных с ДЛК. Большинство из полученных цифр были до этого неизвестны. Результаты представляют фундаментальный интерес для математики. Также мы составили коллекцию из порядка 10 млн канонических форм ортогональных диагональных латинских квадратов. Тройку в их составе мы не нашли, зато обнаружили и описали множество комбинаторных структур на их базе. Сейчас анализируем свойства этих ДЛК, ищем закономерности. Построение коллекции продолжается.

Обо всех результатах мы пишем на странице проекта в Wikipedia, на форуме. Также я сообщаю о свежих новостях на своей странице во «ВКонтакте», с тегом #OLDS. В целом, данное направление живет и развивается. Нам проект на BOINC дает неплохие вычислительные мощности для решения имеющихся задач.

RakeSearch

Чем занимается: исследованием свойств диагональных латинских квадратов.

Наталия Никитина, научный сотрудник лаборатории телекоммуникационных систем Института прикладных математических исследований КарНЦ РАН, руководитель проекта RakeSearch

Одна из целей проекта — заинтересовать людей математикой, рассказывая в научно-популярной форме о сути проводимых вычислений. Я не раз становилась свидетелем, как из простого любопытства вырастает глубокое увлечение наукой. Люди начинают проявлять больше интереса к проектам, высказывают свои идеи по оптимизации процесса вычислений. Так, на форуме RakeSearch активно обсуждают программный код проекта — он открыт для всех участников. Один из волонтеров, знакомый со специфическими особенностями языка программирования, предложил вариант существенного ускорения вычислений. И мы его успешно внедрили. Буквально на днях мы завершили исследовать свойства пространства ДЛК 10 ранга. Сейчас взяли паузу на обработку полученных результатов и временно не раздаем задачи волонтерам. Но закрывать проект пока не планируем.

Проекты-агрегаторы

Существуют инициативы, под «крышей» которых реализуются сразу несколько исследований. Подключение к таким проектам позволяет вкладывать мощности сразу в несколько научных областей либо легко «перекидывать» их с одного исследования на другое.

World community grid

Сайт-агрегатор с приятным интерфейсом сразу предлагает ознакомиться с актуальными проектами. Сейчас их семь, на любой вкус. Присоединившись к WCG, вы поможете исследованиям, посвященным микробиому, детскому раку, СПИД, туберкулезу и даже прогнозированию дождей в Африке. Без исследования COVID-19 тоже не обошлось.

Еще несколько проектов, на которые стоит обратить внимание

nanoHUB@home

Этот проект собирает мощности для сообщества nanoHub, в которое входят ученые и студенты со всего мира. Научная область — нанотехнологии. У сообщества есть сайт, где в открытом доступе лежат материалы и инструменты для исследований и обучения в области нанотехнологий. Мощности добровольцев идут в основном на построение различных симуляций.

GPUGRID

Из названия можно понять, что в рамках данной инициативы котируются только мощности графических процессоров. Они идут на создание биомолекулярных симуляций высокого качества. Пользуются пожертвованиями волонтеров испанские ученые из Университета Помпеу Фабра в Барселоне. Из плюсов: у сообщества есть живой Twitter, в котором публикуются все важные новости и обновления проекта.

Надеемся, этот текст вдохновил вас на вступление в ряды волонтеров проектов добровольных вычислений. Пандемия коронавируса заставила переосмыслить многие вещи, и переосмысление отношения к volunteer computing — лишь одно из них.
Ссылки:
https://3dnews.ru/1008352
https://flings.vmware.com/vmware-app...r-folding-home
https://selectel.ru/about/newsroom/n...koronavirusom/
https://boinc.berkeley.edu/
https://boinc.ru/
https://wiki.archlinux.org/index.php/BOINC
http://slc.tl/sFAZQ
https://www.worldcommunitygrid.org/r...AllProjects.do


Нажмите на изображение для увеличения
Название: -94-qrrozasiziaj1ppv74ojab8.jpg
Просмотров: 34
Размер:	153.7 Кб
ID:	57691

Нажмите на изображение для увеличения
Название: g7nspfhimxnzfaoyvzlioayqyhk.png
Просмотров: 48
Размер:	55.2 Кб
ID:	57692

Нажмите на изображение для увеличения
Название: inyhxggszlp7ayfobv-7pfqwlpi.jpeg
Просмотров: 45
Размер:	109.0 Кб
ID:	57693

Нажмите на изображение для увеличения
Название: k2qndg_3a98w-b7mtwhxepr4rlc.png
Просмотров: 35
Размер:	111.4 Кб
ID:	57694

Нажмите на изображение для увеличения
Название: u_voviua-eilnfmo36l98u_-dim.png
Просмотров: 43
Размер:	229.9 Кб
ID:	57695
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 26.06.2020, 18:40   [включить плавающее окно]   #386
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Проект Minecraft@Home.

Проект Minecraft@Home.

Многие новые участники присоединились к объявлению SalC1 и опубликованию нашего проекта на сайте BOINC. Мы приветствуем и надеемся увидеть всех участников, чтобы увидеть вклад сообщества, развитие и достижения.

Minecraft@Home - это исследовательский проект направлен на изучение фундаментальных законов вселенной Minecraft, чтобы дать ответы на вопросы, касающиеся возможностей и истинных границ данной игры, у которых пока нет ответов.

Minecraft в настоящее время является самой продаваемой видеоигрой всех времен. Хотя мы не имеем никакого отношения к Microsoft, Mojang или разработке самого Minecraft; этот проект родился по необходимости. У многих членов сообщества есть желание подтолкнуть к изучению истинных границ данной игры, у которых пока нет ответов.

Список Minecraft @ Home позволяет пользователям более эффективно присоединиться к проекту. Добровольные вычислительные ресурсы необходимы для успеха нашего исследования, поскольку некоторые элементы требуют больших объемов вычислительной мощности для получения результатов.

Как многие, возможно, видели в последней партии рабочих модулей, у нас был ряд ошибок и проблем. Мы считаем, что они в основном сглаживаются.

BOINC - это опыт обучения для всех нас. Технологии грид-вычислений очень новы для нас, поэтому, конечно, были некоторые проблемы с изучением.

Мы просим сообщество поддержать нас, поскольку мы совершенствуем наши рабочие процессы разработки и планируем выпустить больше проектов и интересных новостей в ближайшие недели.

Если вы пропустили наше предыдущее объявление о рекордном кактусе, обнаруженном Minecraft@Home, посетите наш Twitter: https://twitter.com/minecraftathome

Если вы являетесь экспертом BOINC, разработчиком или иным образом увлечены Minecraft и нашим проектом; Пожалуйста, присоединяйтесь к нашему Discord! https://discord.gg/xVFh9bp

Организаторы проекта завершили бета-тестирование и отправили на обработку 1 млн. 200 тыс. заданий в программе BOINC. https://boinc.ru/forum/
Нажмите на изображение для увеличения
Название: sm.0fe20042_0bb8_4781_82f4_7130f928b021.0.750.jpg
Просмотров: 61
Размер:	304.5 Кб
ID:	57705
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 28.06.2020, 08:30   [включить плавающее окно]   #387
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Большой адронный коллайдер - кольцевой ускоритель

Большой адронный коллайдер - кольцевой ускоритель

СПОЙЛЕР »
Большой адронный коллайдер - кольцевой ускоритель

Большой адронный коллайдер - кольцевой ускоритель заряженных частиц на встречных пучках с кольцом длиной 26,65 км, проходящим под территориями Швейцарии и Франции. Реализация проекта CMS объединит мировой опыт создания и эксплуатации больших экспериментальных установок, накопленный во всем мире на протяжении последних десятилетий. Подобно тому, как открытие атомной структуры, волновых свойств материи и квантовой механики в начале ХХ столетия обеспечило быстрое развитие науки и технологий, результаты экспериментов на LHC не только дадут возможность установить фундаментальные законы физики частиц, но и могут привести к открытиям, которые определят генеральное развитие науки и технологии в XXI веке.
Проект ускорителя задуман как крупномасштабная международная программа. России было предложено участвовать в его создании. Договоренность закреплена в Протоколе об участии в проекте, подписанном 14 июня 1996 г. CERN и Миннауки России по поручению Правительства Российской Федерации. Согласно этому документу российские институты и промышленные предприятия произведут высокотехнологичное оборудование на сумму 200 млн швейцарских франков в течение 10 лет. Финансовый вклад России, определяющий масштаб последующего участия российских физиков в экспериментах на коллайдере, должен составить 133 млн швейцарских франков, а инвестиции CERN и других западных партнеров в Россию - более 66 млн швейцарских франков. Несмотря на то что финансовый вклад России составит менее 5% общей стоимости проекта, реальная доля участия российских физиков в последующих экспериментальных исследованиях на этом уникальном комплексе составит в среднем 16%. Это результат признания значительного интеллектуального и технологического вклада российских ученых в развитие физики высоких энергий вообще и в осуществление проекта LНС, в частности.
Новый ускоритель будет установлен в уже существующем в CERN кольцевом тоннеле, созданном для электронно-позитронного коллайдера LЕР, и станет крупнейшим в мире ускорителем заряженных частиц.
Ввод ускорителя в строй намечен на 2006-2007 гг. На коллайдере будут изучаться столкновения двух пучков протонов с суммарной энергией 14 ТэВ/протон. Эта энергия в миллионы раз больше энергии, выделяемой в единичном акте термоядерного синтеза.
Россия принимает участие как в строительстве ускорителя, создании детекторов, так и в последующих научных исследованиях с их использованием. Координатором проекта от России и стран-участниц RDMS является ОИЯИ (г. Дубна).
На ускорителе LНС планируется проведение экспериментов ATLAS, СМS, ALICE, LНСb, для каждого из которых на кольце ускорителя будет построен свой инструмент - детектор частиц. В центре каждого детектора будут сталкиваться протоны с частотой около 800 млн раз в секунду. Каждое столкновение даст около 10 млн единиц информации. Для обработки этой информации создаются совершенное электронное оборудование и математическое обеспечение, а также разрабатывается новейшая информационная технология GRID.
Детектор СМS - универсальный физический прибор целью которого является регистрация новых частиц высоких энергий. На этом приборе будут проверяться положения "стандартной модели" физики частиц, в частности, механизм Хиггса, согласно которому все частицы приобретают массы при взаимодействии с "хиггсовскими полями", заполняющими все пространство. На детекторе попытаются обнаружить новую частицу (хиггсовский бозон), связанную с этими полями. Будут проверяться следствия теории SUSY - концепции "суперсимметрии" - стоящей за пределами "стандартной модели". Теория SUSY объясняет, почему при разных взаимодействиях могут возникать разные силы, теория также может объяснить наличие "темного" вещества, ответственного за ускорение расширения Вселенной. На детекторе будет проверяться предположение о том, что кварки и лептоны не являются фундаментальными частицами, а также будет производиться поиск новых неизученных явлений. В целом детектор СМS будет иметь 15 млн индивидуальных детекторных каналов, контролируемых мощными компьютерами. Общая масса 12 500 т; высота 15 м; длина 21,6 м, магнитное поле 4 Тл.
В разработке детектора участвуют более 60 научных организаций из 33 стран мира. В июне 1999 г. ассоциированным членом коллаборации СМS стал ГУП ЦВТТ НИКИЭТ. Но еще с 1997 г. ГУП ЦВТТ НИКИЭТ принимает участие в разработке механических конструкций торцевых адронных калориметров совместно с Лабораторией физики высоких энергий ОИЯИ (г. Дубна) и Институтом физики высоких энергий (г. Протвино).
Сложность задачи, поставленной перед ГУП ЦВТТ НИКИЭТ, заключалась в том, что система крепления торцевых адронных калориметров должна обеспечивать точность изготовления и монтажа конструкции весом -300 т на уровне десятых долей миллиметра с учетом деформаций и перемещений под действием как веса, так и больших сил, создаваемых магнитным полем напряженностью 4 Тл. При этом должно быть гарантировано точное позиционирование передней мюонной станции, измеряющей траектории мюонов с точностью до десятка микрон.
В сентябре 1999 г. между Минатомом России, ОИЯИ и Государственным комитетом по науке и технологиям Республики Беларусь был подписан документ "Соглашение по организации технического сопровождения изготовления механических конструкций торцевых адронных калориметров, контролю качества и приемке готовой продукции", в соответствии с которым на ГУП ЦВТТ НИКИЭТ возложена ответственность:
за подготовку полного комплекта рабочей конструкторской документации механической части торцевых адронных калориметров, включая монтажное оборудование;
проведение прочностных расчетов силовых конструкций торцевых адронных калориметров;
входной контроль материалов, из которых изготавливаются детали механических конструкций в соответствии с техническими требованиями;
поставку материалов на ГП "МЗОР" (Республика Беларусь) по согласованному перечню в пределах средств, выделяемых Минатомом России и Минпромнауки России в соответствии с графиком;
приемку готовой продукции.
ГУП ЦВТТ НИКИЭТ поручено разработать технологию монтажа торцевых адронных калориметров в CERN и нестандартное монтажное оборудование. Проделанная работа получила положительное заключение службы технической безопасности CERN.
По итогам выполнения названного выше комплекса работ получен дополнительный заказ CERN на разработку технологии и производство заготовок (плиты и прутки) с повышенными прочностными характеристиками из кремнистой латуни ЛК75-0,5, который выполнен в 2000 г. ГУП ЦВТТ НИКИЭТ, ИЦ ИЦП МАЭ и ОАО "Красный Выборжец" совместно разработали технические условия на производство горячекатаных латунных плит и холоднодеформируемых прутков. Совместно с ОАО "Ижорские заводы" внесены изменения в технические условия на изготовление стальных плит толщиной 134-138 мм из стали 03Х20Н16АГ6. Контроль качества промышленных партий металлопродукции проведен испытательным центром ИЦП МАЭ. Выполнено около 1400 испытаний по определению химического состава и механических свойств при различных нагрузках. Многие результаты испытаний контролировались CERN.
В 2000 г. на ГУП ЦВТТ НИКИЭТ была возложена ответственность за монтаж торцевых адронных калориметров и интерфейсной системы на детекторе CMS. В ноябре 2002 г. успешно осуществлен монтаж первого торцевого адронного калориметра с интерфейсной системой.
С 2000 г. ГУП ЦВТТ НИКИЭТ совместно с Лабораторией физики высоких энергий ОИЯИ участвует в создании передней мюонной станции и оборудования для ее монтажа на детекторе. ГУП ЦВТТ НИКИЭТ уже проведены испытания теплотехнической надежности электроники передней мюонной станции.
Здесь мы приводим интервью с д.ф.-м.н. Владиславом Ивановичем Манько, руководителем проекта ALICE / PHOS на строящемся в ЦЕРН'е (Женева) Большом адронномколлайдере( LHC ). Оригинальная статья находится тут.
Бытует мнение, что ЦЕРН обеспечил работой 650 российских физиков-ядерщиков. Насколько это утверждение верно?
В.И.М. В этом вопросе акценты расставлены несколько неверно. Действительно, российские физики участвуют во всех 4-х экспериментах, запланированных на LHC, а также в сооружении самого коллайдераLHC . Эту возможность им предоставило Правительство Российской Федерации, подписавшее Соглашение с ЦЕРН'ом об участии России в подготовке и проведении экспериментов на LHC. Работу российских физиков в ЦЕРН'е оплачивает Министерство промышленности, науки и технологий России. Разработки и создание оборудования для экспериментов и ускорителя оплачивают два российских министерства – Министерство по атомной энергии и Министерство промышленности, науки и технологий. Так что верно утверждение - Россия вносит серьезный вклад (пока на уровне создания оборудования) в строительство Большого АдронногоКоллайдера в ЦЕРН'е. Единственный крупный физический проект, идущий под руководством российских физиков, это – большой электромагнитный спектрометр ALICE / PHOS для эксперимента ALICE. Но и в других экспериментах в разном объеме также задействованы российские физики. А дальше, после запуска LHC, российские физики в зависимости от завоеванных на сегодняшнем этапе позиций будут проводить эксперименты, вне сомнения, на передовых рубежах науки.
В чем суть экспериментов по проекту ALICE?
В.И.М. Проект ALICE / PHOS осуществляют несколько российских институтов во главе с Курчатовским. Это - ИФВЭ (Протвино), Российский федеральный ядерный центр (Саров) и ОИЯИ (Дубна). Кроме российских, в проекте участвуют ещё 9 институтов из 7 стран.
ALICE (A L arge I on C ollider E xperiment) - единственный эксперимент с тяжелыми ионами на будущем коллайдере LHC (другие 3 эксперимента связаны с физикой элементарных частиц). Главная цель эксперимента – создать в лаборатории сгусток кварк-глюонной плазмы, найти её сигналы и исследовать свойства. Единственный чистый, неискажённый сигнал – это электромагнитное излучение, для исследования которого и предназначается электромагнитный спектрометр ALICE / PHOS. Фазовый переход в кварк-глюонную плазму может произойти при энергиях столкновения тяжелых ядер, которые планируется достичь на ускорителе LHC. Ранее (с 1987 года) эксперименты с кварк-глюонной плазмой проводились в ЦЕРН'е на ускорителе SPS , в настоящее вре- мя они продолжаются в Брукхэйвенской национальной лаборатории ( BNL ) на коллайдере RHIC ( R elativistic H eavy I on C ollider), а затем будут продолжены на новом уровне с помощью детектора ALICE на LHC .
Один из основных параметров при столкновении тяжелых ионов – это энергия в системе центра масс. В ЦЕРНовской программе на SPS эта энергия (т.н. "корень из S") была 17ГэВ на пару нуклонов, на RHIC она составляет 200ГэВ на пару нуклонов, на LHC она составит уже 5.5ТэВ (5500ГэВ) на пару нуклонов. Именно при такой энергии столкновения тяжелых ядер может сформироваться долгоживущий (конечно, по ядерным масштабам) сгусток кварк-глюонной плазмы. И исследовать ее – одна из задач ученых Курчатовского института. В земных условиях кварк-глюонная плазма может быть сформирована только путем столкновения разогнанных до сверхскоростей тяжелых ионов. Кварк-глюонная плазма – это то состояние вещества, в котором находилась наша Вселенная в первые мгновения после Большого взрыва в течение первых 10-5 секунд. Затем Вселенная стала быстро расширяться, кварк-глюонная плазма перешла в нормальную материю. Сейчас физики пытаются воспроизвести это первоначальное состояние в Земных условиях.
Традиционный вопрос - не случится ли вследствие этого эксперимента образование новой Вселенной и гибель нашей?
В.И.М. Не произойдет. Этот вопрос остро стоял перед запуском RHIC. Дискутировался вопрос, не образуется ли в результате эксперимента черная дыра, в которой погибнет наша Вселенная, или, по меньшей мере, наша Земля. Для снятия опасений была создана специальная комиссия, которая пришла к выводу, что вероятность такого развития событий просто равна нулю, потому что события будут разворачиваться на очень небольших масштабах, образовавшийся сгусток кварк-глюонной плазмы будет иметь масштабы атомного ядра и "жить" очень короткое время. Для Земли ничего страшного не произойдет.
Возвратимся к эксперименту ALICE?
В.И.М. На рис. 1 показано столкновение двух ядер (они на рисунке выглядят не как сферы, а в виде плоских дисков, приобретя такую форму за счет лоренцева сжатия). Теория предсказывает, что переход к состоянию кварк-глюонной плазмы наступит по достижении плотности энергии ~2ГэВ/фм 3 (кубический ферми). Для сравнения, плотность энергии в нормальном ядре 0.17ГэВ/фм3. При превышении нормальной ядерной плотности больше, чем в 10 раз может наступить фазовый переход в состояние кварк-глюонной плазмы. Последняя отличается от нормальной материи тем, что кварки и глюоны в ней являются свободными (тогда как в нормальной материи имеет место явление конфайнмента, т.е. ни кварки, ни глюоны свободно не существуют).
Ядра на подлёте друг к другу. Из-за огромных скоростей, близких к световым, происходит их лоренцево сжатие в продольном направлении, и поэтому они выглядят как плоские диски.
Начальная фаза столкновения. Происходят жёсткие столкновения, создаётся огненный сгусток экстремально возбуждённой материи. При условии, что превышена критическая плотность энергии (> 2ГэВ/фм 3) или, другими словами, превышена критическая температура (200МэВ), происходит фазовый переход в кварк-глюонную плазму. Из сгустка вылетают только фотоны, для которых длина свободного пробега много больше размеров сгустка.
Расширение и охлаждение сгустка. При понижении температуры до критической происходит обратный переход из кварк-глюонной плазмы в обычную адронную материю. На всех этапах этой эволюции продолжают вылетать рождающиеся фотоны. Адроны, имеющие длину свободного пробега значительно меньше размеров сгустка, испытывают перерассеяния и меняют свои характеристики в ходе эволюции сгустка.
Завершающая фаза эволюции сгустка (замораживание – freeze-out). Размеры сгустка становятся больше длины свободного пробега для сильного взаимодействия. Все взаимодействия прекращаются, характеристики адронов больше не меняются (состояние системы "замораживается»"). Начинается разлёт адронов (часть из них или продукты их распадов попадают детекторы)
Экспериментальная база для формирования кварк-глюонной плазмы в Земных условиях – это три ускорителя в мире. Два уже существуют (ускоритель SPS в ЦЕРН'е, на котором ядерная программа пошла с 1987 года; затем RHIC в BNL, запущенный в 2000 году), один строится ( LHC в ЦЕРН'е). На коллайдере RHIС энергия пучков 100ГэВ на нуклон, при столкновении в центре масс получается 200ГэВ на нуклонную пару, в LHC – энергия пучков 2750 ГэВ/нуклон, что соответствует 5500ГэВ на пару нуклонов в системе центра масс. На SPS - неподвижная мишень, энергия пучка ядер свинца 160ГэВ на нуклон, но из-за неподвижности мишени в итоге получается 17ГэВ на пару нуклонов в системе центра масс. Все эти эксперименты очень дорогие, проводятся на уникальных ускорителях только в рамках крупных международных проектов, и Россия участвует во всех.
Какова специфика, привносимая в эксперименты именно Курчатовским институтом?
В.И.М. У Курчатовского института сложилась уникальная специализация - физика фотонов, рождаемых при столкновениях ускоренных тяжелых ядер. Фотоны представляют собой очень важный, уникальный инструмент такого рода исследований по одной простой причине. Фотоны испускаются из сгустка непосредственно в момент их рождения без дальнейшего взаимодействия. Дело в том, что фотоны взаимодействуют только электромагнитным образом, их сечение взаимодействия мало, и, следовательно, их длина свободного пробега намного превышает размеры сгустка. Поэтому они вылетают из сгустка в момент своего образования, и тем самым несут неискажённую информацию о его свойствах. Эволюция здесь такая – образуется сгусток плазмы, он постепенно расширяется, охлаждается, в конце концов, его размеры становятся таковыми, что прекращается всякое взаимодействие, и частицы, которые родились при столкновении, разлетаются и доходят до детектора. Родившиеся адроны следуют за эволюцией системы, несут информацию только о последней стадии, когда все остыло (условно остыло, там тоже высокие температуры порядка 90МэВ). Поэтому при регистрации адронов трудно извлечь информацию о ранних стадиях. Тогда как фотоны испускаются на разных стадиях эволюции, следят за эволюцией, и, измеряя температурный спектр фотонов, можно установить и начальную температуру, и дальнейший ее ход.
Курчатовский институт участвовал в исследованиях, связанных с кварк-глюонной плазмой с самого начала исследований, и с самого начала выбрал для себя физику фотонов. Сначала мы построили большой электромагнитный спектрометр, в котором было 10000 детекторов на базе свинцовых стекол.
Где был установлен этот спектрометр?
В.И.М. Спектрометр сначала был установлен на SPS (ЦЕРН). В 1997 году он переехал на RHIC и сейчас вошел в состав эксперимента PHENIX в BNL. Это до сих пор - один из самых больших спектрометров в мире. С его помощью был получен фундаментальный результат – измерен спектр прямых фотонов (опубликован в Phys. Rev. Lett. в 2000 г., это – первый и пока единственный в мире результат). Дело в том, что обнаружение прямых фотонов - очень трудная задача. У них небольшие и сечение возникновения (в результате их рождается очень мало), и сечение взаимодействия. Но в процессе столкновения рождается много адронов, p0-мезонов. Последние, распадаясь, дают два фотона, что создает огромный неустранимый физический фон при регистрации прямых фотонов. Наш спектрометр, благодаря высокой чувствительности, зарегистрировал именно трудно уловимые прямые фотоны.
Таким образом, наша специализация – физика фотонов в столкновениях ядер сверхвысоких энергий. Естественно, мы с этой же физикой вошли и в эксперимент ALICE, в котором специально для этих исследований создается новый фотонный спектрометр PHOS (P HOton S pectrometer) . Проект идет под руководством Курчатовского института. Для этого спектрометра мы выбрали в качестве сцинтиллятора кристаллы вольфрамата свинца PbWO 4 (PWO).
Почему выбраны именно кристаллы вольфрамата свинца?
В.И.М. А дело в том, что для такого рода исследований необходим материал детектора, у которого был бы минимально возможный радиус Мольер и минимальная радиационная длина, чтобы детектор был компактным (для возможности размещения вблизи точки столкновений). Существенное значение имеет радиус Мольер, который определяет поперечный размер электромагнитного ливня. Мольер долго занималась свойствами электромагнитных ливней и ввела понятие радиуса Мольер. Дело в том, что, когда в любой материал попадает фотон высокой энергии, он рождает, как известно, электрон-позитронную пару. Дальше эта пара начинает тормозиться, рождает т.н. тормозные фотоны, и фотоны опять порождают пары – начинается лавинный процесс, т.н. электромагнитный ливень. Этот ливень как раз и преобразуется в сцинцилляционных кристаллах во вспышку света. Точнее, электроны и позитроны начинают возбуждать атомы среды, в которую они попали. Если это – не сцинциллятор, то возбуждается черенковское излучение (так, в свинцовых стеклах мы наблюдаем черенковское излучение). В итоге электромагнитный ливень покрывает в детекторе некоторое пространство. А поскольку в процессе столкновения рождается огромное количество частиц, и если это число частиц попадает на ваш кристалл, он просто "засвечивается", и вы ничего не обнаруживаете. Как раз поперечный размер ливня определяется радиусом Мольер, и нужно выбрать материал с минимальным радиусом Мольер. Тогда вы можете поставить детектор максимально близко к событию, в частности в случае ALICE это – 4.5 метра.
Выбор материала кристалла мы сделали в 1993 г., просмотрев очень много материалов, остановились на PWO. К тому времени это был совершенно новый кристалл, разработанный впервые в Советском Союзе, в Харькове (по-моему), хотя, может быть, разработки велись и в других организациях. Мы на него поставили. Он отвечал двум основным требованиям – он тяжелый (чтобы иметь подходящий радиус Мольер) и является сцинциллятором (т.е. дает максимально яркую вспышку света).
Как развивались события после выбора подходящего для детектора кристалла?
В.И.М. В 1993 году на разработку технологии выращивания кристалла PWO мы получили грант INTAS, и уже тогда много сделали совместно с харьковским предприятием "Монокристалл". Параллельно технология выращивания кристаллов PWO была поставлена на богородицком заводе при участии ИФТТ РАН, Курчатовского института и ряда других институтов (о чем ПерсТ сообщал в вып. 19 с.г.). Богородицку во многом помогли финансовые вливания со стороны ЦЕРН'а через грант МНТЦ – 13 млн. долл. К этому времени этот же кристалл был утвержден для другого церновского детектора CMS (C ompact M uon S olenoid ), на который необходимо было 80 тыс. кристаллов (на ALICE требуется 20 тысяч). Поначалу и CMS, и ALICE обеспечивались кристаллами из Богородицка (мы исследовали богородицкие кристаллы на своем оборудовании). Но в 1999 г. стало ясно, что богородицкий завод не может произвести кристаллы для обоих экспериментов в требуемые сроки (оба эксперимента должны быть запущены в одном и том же году – 2007). Западные физики из CMS, обеспечившие получение гранта МНТЦ, жестко поставили условие обеспечения в первую очередь эксперимента СMS, т.к. это был их вклад в этот эксперимент. В результате оказались под угрозой полного срыва сроки подготовки детектора для эксперимента ALICE.
Тогда мы вспомнили о новом заводе в Апатитах, который сейчас называется "Северные кристаллы". Этот завод к 1989 г. успели построить, но так и не запустили. В своё время непосредственное отношение к строительству завода имел Президент Курчатовского центра академик Е.П.Велихов. К сожалению, прекрасное оборудование, завезенное на завод, даже не успели распаковать, а тем более запустить. Завод простоял (точнее, "пролежал") без работы до 1999 года. К 2001 году мы его реанимировали и в 2002 г. уже поставили в ЦЕРН первые 500 высококачественных кристаллов PWO. Здесь необходимо подчеркнуть, что восстановление завода "Северные кристаллы" в Апатитах, развитие и оптимизация технологии, развёртывание массового производства кристаллов для эксперимента ALICE - всё это стало возможным только благодаря Министерству по атомной энергии Российской Федерации, которое оказало и продолжает оказывать определяющую финансовую поддержку РНЦ "Курчатовский Институт".
Большую роль в становлении технологии сцинцилляционных кристаллов в Апатитах сыграл Станислав Феликсович Бурачас - один из самых крупных специалистов по неорганическим сцинцилляционным монокристаллам, с которым Курчатовский институт еще в 1993 году ставил технологию на харьковском «Монокристалле». Бурачас согласился переехать в Аппатиты и быстро поставил там технологию производства кристаллов PWO. Он и сейчас работает на этом заводе. В 2000 г. на завод пришло новое руководство, которое сыграло определяющую роль в преодолении ряда трудных организационных проблем, возникших при восстановлении завода.
Сейчас работа идет в тесной кооперации. В Курчатовском центре организован аттестационный центр, одна из задач которого 100% контроль всех монокристаллов. Контролируются оптические характеристики кристаллов (световыход, зависимость световыхода от времени, прозрачность), радиационная стойкость. В результате совместных усилий удалось существенно повысить световыход кристаллов, повысить их радиационную стойкость. В основе технологии, как и в Богородицке – метод Чохральского, но многие &quotknow-how" принадлежат "Северным кристаллам". Оба российских производителя – богородицкий завод и "Северные кристаллы", имеют одинаково высококачественные кристаллы. Посмотрите на фотографию (рис.2) наших кристаллов, произведенных заводом "Северные Кристаллы" (это фото обошло многие зарубежные научные издания). Такими кристаллами, продуктами высоких российских технологий, можно гордиться!
Апатиты обеспечат плановые сроки поставок кристаллов для ALICE?
В.И.М. Да, былое напряжение снято. На сегодня мы уже отправили в ЦЕРН 3600 кристаллов, количество, достаточное для изготовления первого модуля (всего их должно быть 5). Наша задача в следующем году обеспечить сборку этого модуля. Мы уже изготовили прототип детектора на 256 каналов, который успешно прошел предварительные испытания, в том числе и на пучках ускорителя в ЦЕРН.
По проекту ALICE / PHOS будет изготовлено 5 детекторных модулей, внутри каждого 3584 кристалла PWO. Для увеличения световыхода спектрометр будет охлаждаться до температуры -25? С, достигаемой без больших затрат. Вся система охлаждения делается в Сарове.
"Северные кристаллы" – один из самых больших российских заводов-производителей монокристаллов. На нем имеется 180 ростовых установок, из них 35 – выполняют заказ ALICE, обеспечивая производство 300 кристаллов в месяц (расширение упирается в финансы). Эта производительность позволит нам в плановые сроки обеспечить создание своего детектора. В 2006 году мы должны установить детектор на пучок и в 2007 году приступить к захватывающим экспериментам.
Фотоны в ALICE – это наше всё?
В.И.М. Проект ALICE / PHOS (и создание оборудования, и планирование будущих экспериментов) идет под руководством российских физиков. Кристаллы PWO для электромагнитного спектрометра ALICE / PHOS – главный вклад России в эксперимент ALICE. Решающую роль в его обеспечении играет МинАтом, который вносит определяющий финансовый вклад. Значительные средства предоставляют также Минпронауки и Курчатовский центр. После контроля всех кристаллов в Курчатовском аттестационном центре они отправляются в ЦЕРН, где также работает наша группа физиков, занятых контролем кристаллов непосредственно на пучках и сборкой детектора.
Свет от сцинциллятора регистрируется лавинными полупроводниковыми фотодиодами, которые предоставляются японскими участниками проекта. Как уже было упомянуто, в проекте участвуют учёные ещё 7 стран, но основа детектора – кристаллы вольфрамата свинца создаются в России, и весь проект идёт под руководством российских учёных.
Так что, ответ на вопрос звучит скорее так – "Фотонная физика в ALICE – вся наша!".
Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/

Нажмите на изображение для увеличения
Название: world-community-grid-large-750.jpg
Просмотров: 49
Размер:	39.8 Кб
ID:	57711
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 01.07.2020, 16:26   [включить плавающее окно]   #388
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Физики просят помощи интернет-пользователей в обработке данных Большого адронного кол

Физики просят помощи интернет-пользователей в обработке данных Большого адронного коллайдера

Группа физиков, работающих с Большим адронным коллайдером (БАК), решила сделать эту физическую установку в буквальном смысле слова ближе всем интернет-пользователям. Любой желающий может установить у себя программу-клиент, которая во время простоя будет проводить расчеты в интересах проекта, а затем отсылать их на сервер, сообщает РИА "Новости".

Специалисты Европейской организации ядерных исследований (ЦЕРН) заявляют, что предоставили людям самим шанс заняться поисками гипотетической частицы - бозона Хиггса с помощью программы LHC@Home 2.0, доступной для любого обладателя персонального компьютера, подключенного к интернету.
Первое тестовое приложение, созданное в рамках данной программы, Test4Theory, сейчас проходит стадию бета-тестирования, принять участие в котором ученые предлагают всем желающим.

С помощью новой платформы ученые смогут моделировать результаты столкновений частиц, а затем, сравнивая их с реальными столкновениями в ускорителях, находить отклонения от теории и, следовательно, новые частицы и взаимодействия.

LHC@Home 2.0 - один из проектов Центра гражданской кибернауки (Citizen Cyberscience Centre), созданного при партнерстве ЦЕРНа, Института обучения и исследований ООН и университета Женевы.

Программа представляет собой традиционное клиентское решение для распределенного анализа данных, поступающих с коллайдера. Она позволит использовать невостребованные мощности пользовательских ПК для обработки огромных объемов информации, поступающих с БАКа - при очень низких расходах.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/
Нажмите на изображение для увеличения
Название: 1522826896169696596.jpg
Просмотров: 45
Размер:	256.7 Кб
ID:	57713
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 04.07.2020, 08:47   [включить плавающее окно]   #389
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
В США обнародован доклад о поиске внеземной жизни

В США обнародован доклад о поиске внеземной жизни
Feb 17, 2020

Международная команда астрономов представила официальные данные о результатах массового поиска космических радиосигналов, которые могли бы стать доказательством существования внеземной жизни. Исследования были проведены при помощи самого крупного радиоприемника в мире - обсерватории в Грин-Бэнк (США).

Как сообщает EurekAlert, исследование было проведено компанией BreakthroughListen, базирующейся в Калифорнийском университете в Беркли. Доклад о полученных результатах был оглашен на ежегодном заседании Американской ассоциации содействия развитию науки (AmericanAssociationfortheAdvancementofScience).

Команда во главе с аспиранткой Университета Пенсильвании Софией Шейх использовала метод под названием транзитная фотометрия. Он позволяет обнаружить чрезвычайно малые отклонения в спектре видимого света, когда некий космический объект проходит межу нами и какой-либо звездой.

Этот метод широко используется для поиска экзопланет. В данном случае астрономы анализировали сведения, полученные при помощи радиотелескопов Parkes в Австралии и GreenBank в США. Они искали радиосигналы от 20 ближайших звезд в так называемом C-диапазоне - это радиоволны с частотой от четырех до восьми гигагерц.

"Об этом регионе много говорилось ранее, но никогда в нем не проводился целенаправленный поиск, - объясняет София Шейх. - Если бы у других цивилизаций были телескопы, подобные нашему, они бы знали, что в Солнечной системе есть планеты, перекрывающие свет звезды, и даже знали бы, что на Земле существует жизнь. Именно так мы открыли тысячи других экзопланет, поэтому можно предположить, что именно так и другие разумные виды находят планеты. И если они знают, что мы здесь, то могут подать нам сигнал".

Однако, как следует из доклада, Шейх и ее команда пока не нашли никаких технических радиосигналов, которые могли бы указать на существование внеземной цивилизации. Тем не менее, проведенный анализ позволил сократить масштабы поиска, который будет продолжен.
"Мы не нашли никаких инопланетян, - заявил на брифинге для СМИ главный исследователь BreakthroughListen Эндрю Симон. - Но надо учитывать, что мы установили очень строгие ограничения на присутствие в галактике технологически развитых внеземных видов - в пределах радиочастотного спектра 4-8 гигагерц. Полученные результаты позволят тем, кто пожелает улучшить проведенный эксперимент, подняться еще одну ступеньку".

Добавим, что в рамках проекта астрономы направляли телескоп на каждую звезду в течение пяти минут, а потом на такое же время отводили его в сторону. Затем процесс повторяли еще дважды.

В результате были пойманы сотни радиосигналов, которые поначалу были идентифицированы как необъяснимые. Впрочем, объяснение им все-таки нашлось. В большинстве случаев это были земные радиопомехи, а в четырех случаях "инопланетные" сигналы оказались сигналами от пролетающих искусственных спутников.

По итогам исследования компания BreakthroughListen опубликовала почти два петабайта данных. В июне прошлого года был также обнародован петабайт данных, полученных от радио- и оптических телескопов. Объем информации так велик, что исследователи призвали общественность искать вместе с ними данные о потенциальных сигналах от интеллектуально развитых цивилизаций. www.boinc.ru
Нажмите на изображение для увеличения
Название: 7a2f683515f5.jpg
Просмотров: 33
Размер:	143.7 Кб
ID:	57719
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 05.07.2020, 08:50   [включить плавающее окно]   #390
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Команда World Community Grid'sFightAIDS @ Home собралась на совещании Центра HIVE

Команда World Community Grid'sFightAIDS @ Home собралась на совещании Центра HIVE

Автор: исследовательская группа FightAIDS @ Home.11 февраля 2020 г.
Исследователи FightAIDS @ Home недавно встретились в Калифорнии, чтобы обсудить свои планы на будущее проекта.

15 и 16 января 2020 года Центр ВИЧ (ВИЧ-взаимодействия в процессе вирусной эволюции) провел свою ежегодную зимнюю встречу лицом к лицу в Ла-Холье, штат Калифорния, в Исследовательском институте Скриппса. Шестьдесят пять ученых, являющихся членами HIVE со всей страны, присутствовали. Этот финансируемый Национальным институтом здравоохранения США центр был основан директором-основателем профессором Артуром Олсоном, который также инициировал проект FightAIDS @ Home (FAAH) по сетке World Community Grid (WCG) в 2005 году. FAAH и WCG играют важную роль в работе Центра, который объединяет их вычислительные исследования с экспериментальными исследованиями вирусологов, молекулярных биологов, структурных биологов и химиков в рамках HIVE.

На собрании было представлено последнее исследование группы FAAH, в которое вошли работы группы Леви из Университета Темпл, а также лаборатории Олсона в Исследовательском институте Скриппса.
Группа Леви описала текущие вычисления, которые они делают, чтобы найти новые лекарственные препараты-кандидаты. Они используют World Community Grid для оценки и ранжирования соединений, которые были ранее идентифицированы путем виртуального скрининга на молекулу капсида и его сборки. Капсид является новой мишенью ВИЧ для разработки лекарств, и эта новая мишень имеет решающее значение в процессе вирусной инфекции.

Группа Олсона описала новые предварительные виртуальные экраны против капсида, которые могут создавать «ингибиторы самоубийства», соединения, химически связанные с целевым белком. В этом подходе используется химия, разработанная для члена HIVE и лауреата Нобелевской премии Барри Шарплса в Scripps. Обсуждались планы запуска новой виртуальной кампании скрининга с использованием этой химии против капсида на FightAIDS @ HOME.

На двухдневной встрече была освещена последняя работа HIVE по пониманию структуры и функции ВИЧ и того, как инфицированные клетки человека взаимодействуют с вирусом в течение его жизненного цикла. Основное внимание в исследовании уделяется пониманию эволюции вируса и его последствий как для разработки лекарственного средства, так и для поиска лекарства от его устранения или полного подавления вируса в организме человека. Была выражена благодарность за важный вклад, который добровольцы World Community Grid внесли в работу Центра ВИЧ.

Рисунок 1. Участники встречи ВИЧ-инфицированных лицом к лицу,
Январь 2020, Ла Холья, Калифорния

Рисунок 2. Группа FAAH на собрании HIVE (слева направо): Рон Леви, Арт Олсон, Джулия Бьянко, АвикБисвас, Нанджи Дэн, Циньфан Сунь, СтефаноФорли.

Хотите принять участие в борьбе с ВИЧ, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/

https://www.scripps.edu/hive_center/index.html
https://www.worldcommunitygrid.org/r...ah/overview.do
https://ronlevygroup.cst.temple.edu/...up_people.html
http://mgl.scripps.edu/projects
Нажмите на изображение для увеличения
Название: faah_update_fig2.jpg
Просмотров: 37
Размер:	54.4 Кб
ID:	57743

Нажмите на изображение для увеличения
Название: faah_update_fig1.jpg
Просмотров: 40
Размер:	48.5 Кб
ID:	57744
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 09.07.2020, 20:14   [включить плавающее окно]   #391
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Компьютерный кластер команды проекта "РадиоАстрон" 09.07.2020

Компьютерный кластер команды проекта "РадиоАстрон" 09.07.2020

Сегодня связался с одним человеком из команды проекта "РадиоАстрон", чтобы узнать конфигурацию их компьютерного кластера. В ответ на мое письмо он предоставил эту ссылку. Там на 5-й странице написано, что кластер изначально состоял из 10 узлов и 100 процессоров общей производительностью в 1 Тфлопс/сек (на тесте Linpack), а также системы хранения данных объемом 200 ТБ; скорость передачи данных была 10 Гб/сек.

ftp://jet.asc.rssi.ru/outgoing/yyk/R...k_No3_2012.pdf


После расширения кластера он получил следующие характеристики:


- онлайн система хранения данных для сбора информации - 450 Тб


- онлайн система хранения данных для обработки данных - 85 Тб


- онлайн система хранения данных для обработки результатов - 310 Тб


- система хранения архивных данных на жестком диске - 4 500 Тб


- система хранения архивных данных на магнитных данных - 4 500 Тб


- система резервного хранения данных - 20 Тб


- совокупный объем системы хранения данных - примерно 10 Пб


- мощность - 1 Тфлопс/сек


- каналы передачи данных по сети со скоростью 1 и 10 Гб/сек


- Интернет-соединение - 800 Мб/сек


ftp://jet.asc.rssi.ru/outgoing/yyk/R...03898-main.pdf
Нажмите на изображение для увеличения
Название: radioastron.v2.rgb-forscreen.jpg
Просмотров: 28
Размер:	378.6 Кб
ID:	57775

Нажмите на изображение для увеличения
Название: radioastron-5let.jpg
Просмотров: 30
Размер:	293.3 Кб
ID:	57776

Нажмите на изображение для увеличения
Название: unnamed.jpg
Просмотров: 33
Размер:	54.9 Кб
ID:	57777

Нажмите на изображение для увеличения
Название: unnamed.png
Просмотров: 33
Размер:	177.4 Кб
ID:	57778

Нажмите на изображение для увеличения
Название: image4.jpg
Просмотров: 40
Размер:	238.1 Кб
ID:	57779
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 11.07.2020, 09:24   [включить плавающее окно]   #392
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Мировое сообщество объединяется, чтобы найти биомаркеры рака.

Мировое сообщество объединяется, чтобы найти биомаркеры рака.
17 июня 2020 г.

Резюме

Сойер создал команду World Community Grid, чтобы помочь ускорить исследования после того, как у его отца был диагностирован рак мозга. В ходе этого процесса он нашел глобальное сообщество добровольцев, которые помогают ученым в Научно-исследовательском институте в Крембиле находить биомаркеры рака, которые могут улучшить диагностику и лечение.

Знакомьтесь, Сойер

Сойер действительно увлекается компьютерами. Свой первый компьютер он создал в возрасте восьми лет, а через пару лет основал собственную компанию, в которой он построил и продал более 20 компьютеров. В возрасте 11 лет он начал строить криптоминеры.

Затем его отцу Бретту поставили диагноз рак мозга.

Краткие факты о раке и биомаркерах

Рак является второй по значимости причиной смерти во всем мире, на его долю приходится примерно 9,6 миллиона смертей, или один из шести случаев смерти, в 2018 году. (Более подробную информацию и факты о раке см. На сайте Всемирной организации здравоохранения).

Рак начинается из-за генетических или экологических изменений, которые мешают биологическим механизмам, которые контролируют рост клеток. Эти изменения могут быть обнаружены в образцах тканей благодаря наличию их уникальных химических показателей, таких как ДНК, белки или метаболиты, которые вместе известны как «биомаркеры». Группа таких биомаркеров называется подписью.

Структура биомаркеров может определить, подвержен ли человек развитию конкретной формы рака, а также может предсказать прогрессирование заболевания, помогая предложить лучшее лечение для данного человека. Например, два пациента с одной и той же формой рака могут иметь разные исходы и по-разному реагировать на одно и то же лечение из-за своего уникального генетического профиля в сочетании с потенциально различным образом жизни.

Хотя уже известно, что некоторые биомаркеры связаны с определенными видами рака - в основном выявляются пациенты, которым грозит риск (например, мутации BRCA1 или BRCA2 при раке молочной железы и яичников), еще многое предстоит открыть. Вычислительные исследования могут помочь ускорить процесс обнаружения, но исследователям нужны огромные вычислительные мощности, чтобы сделать это возможным.

Помощь больным раком и поиск сообщества

Сойеру было всего 11 лет, когда его отец (на фото слева вверху) начал лечение рака головного мозга, но он провел некоторое исследование, нашел проект World Margrid Grid, посвященный картографированию маркеров рака, и понял, что может помочь. «У меня были эти мощные криптоминеры в моем подвале, и я понял, что могу использовать World Community Grid для них, чтобы помочь людям с раком, как мой папа», - говорит он.

Вот как это работает: люди со всего мира присоединяются к World Community Grid, загружая безопасную программу на свои компьютеры или устройства Android. И когда их устройства имеют какую-либо неиспользуемую вычислительную мощность, они автоматически проводят сравнение данных, чтобы определить потенциальные биомаркеры в фоновом режиме для доктора Игоря Юрисика в Научно-исследовательском институте Krembil в Торонто.

В течение нескольких месяцев Сойер не только пожертвовал значительное количество вычислительного времени на своих собственных машинах, чтобы помочь найти биомаркеры рака, но он также создал команду World Community Grid под названием Sawyer Cancer Fighting Network.
«Сойер запустил веб-сайт команды сам - он даже не пустил меня в комнату, пока работал над этим», - говорит Бретт. «Это было довольно удивительно. Рак может заставить человека чувствовать себя очень одиноким, но теперь вместо того, чтобы быть только со мной, речь шла обо всех, кто болен раком».

Сначала Сойер планировал пригласить в свою команду только друзей и семью. Первоначальная цель команды состояла в том, чтобы пожертвовать 100 лет вычислительного времени проекту «Картография маркеров рака». Но затем к ней присоединились другие волонтеры World Community Grid. Через онлайн-форум World Community Grid Сойер встретился с двумя волонтерами («OldChap» из Великобритании и «русалкой» из Дании), которые помогали рекламировать сеть борьбы с раком Сойера и собирали собственные контакты, чтобы присоединиться. Всего за несколько месяцев Сеть борьбы с раком Сойера достигла своей первоначальной цели и поставила перед собой цель. теперь они стремятся пожертвовать 1000 лет вычислительной мощности для картирования маркеров рака к сентябрю 2020 года.

«Изначально я создал команду для поддержки исследований рака, но по пути я нашел сообщество». говорит Сойер.

Бретт, его жена Сьюзен и Сойер поддерживали связь со своими новыми онлайн-друзьями, так как Сеть Сойера по борьбе с раком продолжает расти. Их отношения были особенно важны сейчас, когда OldChap начал собственное лечение рака. «Общение с этими двумя волонтерами World Community Grid и поддержка команды Сойера сделали чудеса для отношений в нашем доме».

«Мы благодарны всем волонтерам Мирового сообщества по изучению грид-карт и картирования рака», - говорит д-р Игорь Юрисика, главный исследователь по картированию маркеров рака. «Без их помощи наше исследование было бы невозможно.

«Хотя мы воодушевлены успехами нашего и наших коллег, перевод исследований в более успешное лечение и профилактику займет некоторое время. Приятно осознавать, что мы работаем над этим как с глобальной командой, поскольку только вместе мы можем решить эти сложные задачи. проблемы «.

Сойеру сейчас 14 лет. Помимо мастерства в компьютерах, он любит математику. Он участвует в баскетболе и теннисе, бегает по пересеченной местности, играет на пианино, гитаре и саксофоне. Он также с нетерпением ждет возможности сыграть роль Мальволио в постановке «Двенадцатой ночи» в театре Фолджера в Вашингтоне.

За два года, прошедшие после первой операции на мозге Бретта, у него была вторая операция, а также лучевая и химиотерапия. Его лечение продолжается, но он говорит: «Мой доктор говорит, что мое состояние« стабильное и постоянное », и это отличное достижение».

На момент написания этой статьи команда Сойера прошла более 40 процентов пути к своей цели - 1000 лет безвозмездного вычислительного времени. «World Community Grid действительно дала мне чувство общности», - говорит Сойер. «Я чувствую, что люди действительно заботятся обо мне».

Любой, у кого есть компьютер или устройство Android и подключение к Интернету, могут присоединиться к сети борьбы с раком Сойера и пожертвовать вычислительные мощности для поиска биомаркеров рака.
Хотите принять участие в борьбе с Раком, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/
https://www.helpsawyerfightcancer.com/how-to-join
Нажмите на изображение для увеличения
Название: Team_Photo.jpg
Просмотров: 30
Размер:	228.2 Кб
ID:	57786

Нажмите на изображение для увеличения
Название: Sawyer1.jpg
Просмотров: 21
Размер:	219.4 Кб
ID:	57787

Нажмите на изображение для увеличения
Название: Sawyer_and_Brett.jpg
Просмотров: 31
Размер:	145.7 Кб
ID:	57788
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 13.07.2020, 08:56   [включить плавающее окно]   #393
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Проект по сохранению микробиома должен продолжаться!

Проект по сохранению микробиома должен продолжаться!
Исследовательская группа по проекту «Микробиомный иммунитет»
11 мая 2020 г.
Исследования во время пандемии важнее, чем когда-либо. Вот как команда проекта «Иммунитет к микробиомам» продолжает прогрессировать, работая дома.
Триллионы бактерий живут внутри и на наших телах. Проект по иммунитету микробиомов использует вычислительную мощность World Community Grid для изучения белков, продуцируемых этими бактериями, которые кодируются в их геномах. Это помогает ученым понять роль микробиома в заболевании.
Мы хотим поблагодарить всех наших волонтеров за помощь в пожертвовании ценного компьютерного времени! На данный момент мы провели более 300 000 последовательностей белков по нашему конвейеру. Благодаря прогнозируемым моделям и нашему новому методу функциональных аннотаций мы наконец-то начали углубляться в анализ наших данных!
Весенняя встреча по проекту «Микробиомная иммунитет» была виртуальной, а не личной в этом году.
Верхний ряд (слева направо): Мария Маранга, Ричард Бонно, ТомашКосчулек
Средний ряд (слева направо): Юлия Келер Леман, Павел Щербяк, Даниэль Беренберг
Нижний ряд (слева направо): Дуглас Ренфрю, ВладмирГлигориевич, Крис Чандлер
Не изображено: Томми Ватанен
Мы должны были встретиться в Нью-Йорке в марте на нашем очередном общем собрании. Однако из-за пандемии COVID-19 эта встреча не могла состояться лично. Вместо этого у нас было несколько часов видеозвонков через Zoom в эти три дня, 18-20 марта. Во встрече приняли участие исследователи из США (Нью-Йорк), Польши и Новой Зеландии. Трудно было найти время, подходящее для всех в этих трех разных часовых поясах по всему миру, но мы справились.
Прогресс
Наша статья о функциональной аннотации из последовательности и структуры (вы можете проверить препринт здесь) была отправлена и в настоящее время находится на рассмотрении. Мы держим пальцы скрещенными для положительных отзывов!
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/786236v1
Мы также работаем над еще двумя работами, которые углубляются в данные, собранные в ходе этого проекта, как экспериментальные, так и наши прогнозы. Для этого мы начали работать с базой данных, которая делает эти данные легко доступными и анализируемыми для нас как для группы, а затем для всего научного сообщества и для всех вас! Многое еще предстоит сделать, но позвольте заверить вас, что мы делаем успехи. Для решения этих проблем у нас также есть несколько новых членов в нашей группе, которые могут помочь нам. Польская команда становится еще больше благодаря аспиранту и докторантуре, а у нашей команды в Нью-Йорке есть еще один инженер-программист, который помогает нам в настройке баз данных. Добро пожаловать в нашу команду: Павел, Мария и Крис.
https://amarolab.ucsd.edu/news.php
Из других важных событий, член исследовательской группы Брин Тейлор успешно защитила кандидатскую диссертацию 14 апреля. В соответствии со временем ее защита осуществлялась с помощью Zoom, что означало, что большая группа членов семьи, друзей и коллег могла присутствовать. Поздравляю, доктор Тейлор!
Наша исследовательская деятельность всегда включала удаленную работу и онлайн-общение. В эти трудные времена мы работаем так же усердно, как и всегда, и надеемся, что все волонтеры World Community Grid принимают меры для обеспечения безопасности и здоровья. Благодарим Вас за постоянную поддержку!
Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/
Нажмите на изображение для увеличения
Название: mikrobiom.jpg
Просмотров: 38
Размер:	141.6 Кб
ID:	57801
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 18.07.2020, 09:15   [включить плавающее окно]   #394
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Открытые данные распределенных вычислений

СПОЙЛЕР »
Открытые данные распределенных вычислений
13.10.2009 / № 39 / с. 2 / Наука и общество Борис Штерн
Современные крупные эксперименты или наблюдения стоят сотни миллионов, а то и миллиарды долларов. В них участвуют многие десятки, сотни, а то и тысячи соавторов. Их списки в публикациях (как правило, в алфавитном порядке) называются в народе «братскими могилами», и поделом — из них совершенно непонятно кто реально получал результат и делал статью, а кто просто имел какое-то отношение (зачастую весьма формальное) к созданию установки. Таким образом, теряются индивидуальность и свобода исследователя. Происходит «индустриализация» некоторых областей науки со всеми ее «прелестями», типа административной иерархии и доминирования корпоративной политики над наукой. Это реальная проблема некоторых направлений, чреватая деградацией и тупиком. Наиболее перспективный рецепт против деградации — принцип открытых данных, уже зарекомендовавший себя в астрофизике и биологии. Открытые данные не только противоядие от обезличивания научных исследований. Это еще и новый путь людей в большую науку, отменяющий «научную провинцию», дающий шанс совершить научное открытие любому человеку в любом конце мира.
Два маленьких фрагмента из открытых данных эксперимента BATSE, наблюдавшего небо в мягких гама-лучах на протяжении 9 лет. Приведены кривые счета двух детекторов из восьми за время одной орбиты (около 1час. 45 мин.). На кривых видны следующие события. Сверху – до 51800 с – сильный шум от источника Лебедь Х-1, далее зашедшего за горизонт Земли. 54050 с – Лебедь Х-1 вновь показывается над горизонтом, 54560 с – высыпание частиц в магнитосфере Земли, 55000 с – солнечная вспышка, 56300с – восход Крабовидной туманности. http://trv-science.ru/2009/10/13/otkrytye-dannye/2-1-2/
Снизу – 78500 с – высыпание частиц, 79550 с – закат Лебедя Х-1, 80250 с – нетриггерный гамма-всплеск, пропущенный авторами эксперимента. 81700 – восход Лебедя Х-1, 83030 – еще один нетриггерный гамма-всплеск. Синусоподобные изменения в темпе счета – широтные вариации фона частиц, фон выше, когда станциязалетает в высокие широты.
Что понимается под открытыми данными?
Любой научный результат должен быть опубликован в открытой печати, иначе это не результат. Он может иметь справочный характер, например быть каталогом каких-нибудь объектов. В этом случае результат научной работы сам по себе не дает каких-либо новых выводов, но он необходим для дальнейшего продвижения и будет использован многими исследователями. Однако имеющиеся в литературе и в открытом доступе в сети объемные данные справочного характера — еще не то, о чем идет речь. Она идет о гигантских массивах сырой (или прошедшей лишь очевидную первичную обработку) информации, непосредственно выдаваемой аппаратурой. Как правило, эта информация остается в распоряжении авторов эксперимента. Иногда данными делятся, типа «мы вам — данные, вы нас — в соавторы». Иногда ими не делятся вообще. А бывает и так, что данные выкладываются в сеть, в открытый доступ: берите, кто хочет, и ройтесь в них, сколько заблагорассудится.
Это и есть открытые данные. Конечно, сами массивы информации — еще полдела, они должны сопровождаться полной информацией о свойствах и погрешностях аппаратуры, описанием структуры данных и т.п. Смысл в открытых данных появляется там, где их объем велик, а содержащаяся в них информация столь разнообразна, что ее хватит на многих «копателей» («dataminers» — термин, вошедший в обиход). Перейдем к примерам.
Самая масштабная инициатива по открытым данным принадлежит американской Национальной аэрокосмической администрации (NASA). В свое время они приняли принципиальное решение: все данные с аппаратов NASA, будучи оплачены налогоплательщиками, должны быть открытыми для всех. И этот принцип в целом соблюдается.
Например, снимки «Хаббла» или марсианских орбитальных аппаратов являются открытыми в исходном виде: не как обработанные jpeg-и, а как попиксельные данные в разных спектральных диапазонах. А другой известный аппарат, гамма-обсерватория «Комптон», оставила среди прочего массивы отсчетов детекторов гамма-квантов со всей Вселенной за 9 лет непрерывных наблюдений, и чего там только нет! Наконец, сейчас, в сентябре, открыты данные гамма-телескопа «Ферми», которыми мы воспользовались для построения изображения, открывающего данный выпуск газеты.
Еще один пример больших массивов данных, открытых для всеобщего изучения, — геном человека и других животных. Но это уже предмет для других авторов.
Коллизия интересов?
С какой стати авторы эксперимента должны выкладывать для всеобщего пользования свои драгоценные данные, добытые в результате многолетних трудов? В них вложена часть души в расчете на урожай в виде приоритетных научных результатов! Это с одной стороны. С другой стороны, откуда у авторов огромные средства на эксперимент? От налогоплательщиков! И последние вправе сказать: данные — на бочку! — они получены на деньги общества и должны быть общественным достоянием. А некоторые авторы могут возразить: зачем обществу сами данные? За государственные деньги заказан результат — научные факты, и мы эти факты излагаем в открытых научных статьях. И вот в этом месте воображаемые авторы совершенно не правы.
Срез трехмерной карты Вселенной, точками изображены галактики и скопления галактик. Мы находимся в центре. Радиус круга – около двух миллиардов световых лет
Зачем общество оплачивает удовлетворение любопытства ученых? Ради научных фактов? Как правило, в наименьшей степени ради них самих. Оно оплачивает саму систему выработки и организации знаний, методологию научного поиска и развития вкуса людей к поиску, наконец, налогоплательщики оплачивают воспроизводство носителей и добытчиков знаний. Рядовой налогоплательщик вряд ли понимает это, но интуитивно чувствует, что, платя за науку, в накладе не останется. И не остается. И вот именно ради этих целей данные должны быть открытыми. Обществу важно, чтобы с ними работало как можно больше людей, чтобы исследователи конкурировали друг с другом и учились выжимать из данных все, что можно, оттачивали мастерство и придумывали новые приемы и методы.
Есть и еще один аспект: посторонние исследователи, взгляд которых свеж и не замылен, обычно легко обнаруживают в данных всякий брак, систематические погрешности, пропущенные авторами, и т.п. И к тому же открытость требует досконального документирования всего эксперимента и описания всех погрешностей. Таким образом, открытые данные -это еще и способ контроля за качеством эксперимента.
…Итак, принцип открытости данных нужен обществу, но не лишит ли он исследовательские коллективы мотивации к разработке и созданию сложных установок? Ведь кто-то другой может увести из-под носа результаты, да еще и свой нос будет совать в самую кухню, где еще водятся всякие жучки (в просторечии «баги») и тараканы. В целом, чем сильней команда эксперимента, тем меньше ее должна беспокоить открытость данных.
Впрочем, есть достаточно простой компромисс — временное эмбарго на данные. То есть они выкладываются в сеть с задержкой, например, на полгода, что позволяет команде выловить всех жучков и тараканов и успеть снять сливки. Если это «богатые» данные, со сложной универсальной установки — «молока» там хватит на многих.
А тем временем в Европе…
В то время как NASA последовательно придерживается принципа открытых данных, в Старом Свете с этим сложней. Впрочем, Европейское космическое агентство ESA, по крайней мере в крупных экспериментах, следует если не принципу полной открытости, то хотя бы принципу конкурсности и прозрачности в вопросе доступа к данным. Возьмем для примера миссию «Интеграл» — большой аппарат, наблюдающий в рентгеновском и мягком гамма-диапазонах. В отличие от орбитальных обсерваторий «Комптон» и «Ферми», у него сравнительно узкое поле зрения, и встает вопрос, что наблюдать. Изначально был запланирован ряд очевидных приоритетных наблюдений, например скан плоскости Галактики. На оставшееся время проводится открытый конкурс заявок любых исследователей из стран-участниц (Россия входит в их число) на наблюдения разных объектов. Заявки рассматриваются экспертным комитетом, куда входят люди из разных стран, в том числе и из России. Победившие заявки утрясаются по срокам и включаются в программу наблюдений. Победители наделяются правами на данные (data rights), т.е. они, и только они, получают данные именно на то, что запрашивали в заявке. Но в поле зрения кроме заявленных объектов попадает много чего еще. И тут проводится второй тур заявок — на бесхозные объекты в запланированных полях наблюдения. Победители, и только они, получают данные по запрошенным объектам. Конкурс, как правило, невелик, и зачастую права на данные получают вопреки ужасающе низкому научному уровню обоснования.
По-моему, это более-менее разумная схема, во всяком случае -первый тур. Будь моя воля, я бы отменил второй тур и открыл бы все данные. Правда, они и так открываются со временем.
С национальными европейскими проектами все не так. Для примера возьмем итальянский (с российским участием) эксперимент PAMELA — магнитный спектрометр в космосе. Основное предназначение — измерение потока античастиц и (вдруг!) антиядер. Тут не то что речи нет об открытых данных, тут ощущается дух свирепого собственника. Мой знакомый, русско-финский профессор, обратился к команде «Памелы» с запросом по поводу данных о низкоэнергетических частицах, которые не относятся к основной цели эксперимента. Это в большинстве частицы солнечного происхождения, несущие информацию об активности Солнца и земной магнитосфере. Он спросил, на каких условиях может получить эти данные. И получил ответ: ни на каких.
С «Памелой» также связан довольно известный скандал. Они показали на конференции предварительные данные, кто-то сфотографировал их из зала и опубликовал (со ссылкой) в теоретической работе. Авторы эксперимента разразились гневными реляциями, расценивая это как нарушение авторского права. Теоретик поступил не очень солидно, но реакция команды «Памелы», по-моему, куда больше противоречит духу науки и, если честно, вызывает у меня полное неприятие. Либо не демонстрируйте результаты, либо не запрещайте их воспроизводить и цитировать. Доклад на конференции — это запуск результатов в открытый научный оборот, и понятие копирайта на картинку с результатами — чистый абсурд.
А как насчет Большого адронного коллайдера?
Экспериментальная физика высоких энергий производит огромные массивы разнообразных данных, которых тоже хватает на многих исследователей. Подходит ли принцип открытых данных для физики высоких энергий? Думаю, что большинство экспериментаторов ответят — нет. Подозреваю также, что они при этом будут неправы. Тут, конечно, есть техническая проблема — гигантский объем данных. Но она не фатальна: пусть данные будут открыты хотя бы для профессионалов, имеющих к ним доступ по специальным каналам с быстрым трафиком. Гораздо большая проблема — в психологии, традициях и организационных принципах, сложившихся в физике высоких энергий. Сейчас данные не являются открытыми даже в пределах огромных коллективов — за них торгуются, их распределяют, а публикуют результаты все равно в «братских могилах». Индивидуальность исследователя проявляется разве что в докладах на конференциях. Сложившиеся традиции отталкивает от данной области науки людей, для которых самостоятельность и свободный поиск являются важнейшими ценностями.
Это — в общем, теперь пару слов о Большом адронном коллайдере, который стоит несколько миллиардов евро. Поток информации с его установок будет беспрецедентным: чтобы его переварить, потребуются распределенные вычисления огромного числа массивов компьютеров в разных концах мира (система «grid»). Уметь управляться с таким потоком информации — уже большое достижение и ценнейший опыт. Далее, количество информации сжимается -сигналы с детекторов превращаются в события с параметрами вылетевших лептонов и адронных струй. И с этой сжатой информацией (ее поток только с установки CMS составит порядка 30 мегабайт в секунду) уже можно делать физику.
Будь я большим начальником, представляющим интересы налогоплательщиков, я бы сказал:
— Так и быть, в течение года (условного) после физического пуска обрабатывайте данные как привыкли, открывайте или закрывайте бозон Хиггса и суперсимметричные частицы, публикуйтесь братскими могилами, а по истечении года — данные на бочку (в открытый доступ), вместе с детальной документацией!

Я не являюсь никаким начальником, поэтому меня никто не послушает, да и нет такого начальника, который мог бы на этом настоять (может, и к лучшему, а то бог знает что еще может прийти в голову начальнику). Поэтому остается только пропагандировать эту идею и искать сторонников. Это путь не быстрый, поэтому вряд ли данные БАК будут открыты, пока они еще теплые. А жаль, поскольку открытый доступ к ним существенно повысил бы суммарную квалификацию физиков, уровень развития методов обработки и интерес к науке. Да и вытрясли бы из БАКа больше.
Just do it http://trv-science.ru/2009/10/13/otkrytye-dannye/2-4/
Этот фрагмент — только для очень любопытных и компьютерно-грамотных людей, особенно для тех, в ком бьется горячее сердце хакера. Последним не надо огорчаться, что все описанное ниже легально разрешено. Итак, для примера, учимся доставать и читать свежие данные «Ферми».
Все архивы данных NASA лежат на мощных серверах, где не бывает проблем с трафиком, и достаются либо через анонимный доступ по протоколу ftp, либо через обычный веб-браузер. Пойдем вторым путем, сюда: http://fermi.gsfc. nasa.gov/cgi-bin/ssc/LAT/WeeklyFiles. cgi и скачиваем файлы с названием типа LAT_allsky_239557417.000_ V01.fits — их там больше полусотни, каждый — недельный улов Ферми, их вес — от 300 до 400 мегабайт, так что связь на вашем конце должна быть хорошей.
Данные оформлены в стандарте fits, распространенном в астрономии и астрофизике. На том же сайте есть весь необходимый софт, чтобы читать данные и работать с ними. Я бы не рекомендовал целиком полагаться на этот софт — тогда вы становитесь его рабом и мало чему научитесь. Лучший путь — воспользоваться читалкой fits-файлов Fv (http://heasarc.gsfc. nasa.gov/ftools/fv), которая может конвертировать данные в обычный ASCII-файл и потом работать с ним своими средствами. В результате вы получаете 200 млн гамма-квантов с направлениями и временами прихода, с их энергией и рядом технических данных, нужных для более профессионального анализа. На этом этапе вы как бы получаете хороший, но любительский телескоп, в который вы можете любоваться Вселенной в гамма-лучах за год с лишним наблюдений, изучать переменность объектов и имеете некий шанс открыть нечто ускользнувшее от внимания предшественников.
Если же вам захотелось сделать нечто более серьезное, например изучить спектры каких-либо объектов, вам нужно еще разобраться, как устроена функция отклика детектора, скачать соответствующие файлы и освоить метод «forward folding», позволяющий грамотно работать с данными в условиях реальной жизни, где все перекошено и смещено. Это уже кухня настоящего исследователя, которой, увы, владеют далеко не все из считающих себя таковыми.
«Ферми» — это только для примера. Есть и другие, еще более богатые архивы. Например, архив эксперимента BATSE, наблюдавшего все небо в жестком рентгеновском и мягком гамма-диапазонах на протяжении 9 лет (см. рис. 2). Вероятно, самый захватывающий по своей неисчерпаемости — Сло-ановский цифровой обзор неба (www.sdss.org). Это детальное картографирование Вселенной, причем в трехмерии, поскольку снимаются спектры галактик и определяется красное смещение. Данные, конечно, открыты, и в исследовании Вселенной, по данным SDSS, участвуют сотни волонтеров, среди которых есть и профессионалы, и любители. Временами они находят что-то совершенно новое, например какие-нибудь экзотические, ранее неизвестные типы галактик. Ничто не мешает любому читателю взять да и присоединиться к ним.
Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/


Нажмите на изображение для увеличения
Название: 23-250x248.jpg
Просмотров: 36
Размер:	18.9 Кб
ID:	57831

Нажмите на изображение для увеличения
Название: 2.11-250x251.jpg
Просмотров: 21
Размер:	17.4 Кб
ID:	57832
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 19.07.2020, 12:50   [включить плавающее окно]   #395
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Folding@home - виртуальная битва за благо человечества 02 июня 2010

Folding@home - виртуальная битва за благо человечества
02 июня 2010

Скоро отметит первый юбилей самый мощный в мире проект в сфере распределенных вычислений - Folding@Home. Сотни тысяч людей создали сеть компьютеров, в два раза обгоняющую по производительности самый быстрый суперкомпьютер. Но есть ли результаты?
Без малого десять лет назад, в октябре 2000-го, был запущен проект ученых из Стэндфордского университета, получивший название Folding@home. Идея его была насколько благой, настолько и фантастической. Это сейчас мы привыкли ко всяким облачным игрушкам, вроде антивирусов или даже целых компьютеров. А в далеком 2000-м возможность объединиться всем миром и, овладев тайной свертывания молекул белка, одолеть такие страшные недуги, как болезни Паркинсона и Альцгеймера, склероз, коровье бешенство, диабет второго типа, рак и многие, многие другие, казалась настоящим чудом. И сделать-то для этого надо было всего ничего: просто установить на свой компьютер специальную программку, которая будет использовать свободные вычислительные мощности для обработки относительно небольших порций данных, скачиваемых с главного сервера. Когда расчет закончен, результаты закачиваются туда же, и цикл повторяется снова и снова. Учитывая, что у многих компьютеры работали круглосуточно уже тогда, возможность серьезно помочь человечеству, ничего, по сути, не делая, понравилась многим.
Очень скоро счет участников пошел на тысячи, потом поддержка Folding@home появилась в Google Toolbar, и это сразу увеличило число активных доноров вычислительных ресурсов примерно на 20 000. К пятилетию проекта в нем насчитывалось уже 200 000 активных машин, а производительность обещала перевалить за две сотни терафлопс. Но настоящий рывок случился 22 марта 2007-го, когда вышла версия клиента для PlayStation 3. Процессор Cell, используемый в игровой консоли, оказался потрясающе эффективным для задач Folding@home, и в считанные дни производительность проекта превысила отметку 900 терафлопс - это примерно в четыре раза выше результатов, достигнутых без участия PlayStation.

Консоли PlayStation несколько лет составляли основную мощь проекта Folding@home.


На этом графике хорошо видно, как резко выросла производительность после появления клиента для PS3.

В апреле 2009-го производительность примерно 400 000 систем, постоянно участвующих в Folding@home, достигла внушительных пяти петафлопс. Это в два с нелишним раза больше, чем может сегодня обеспечить самый мощный компьютер планеты - Jaguar (напомним, его производительность составляет 2,3 петафлопс). Правда, с тех пор Folding@home немного сдал, и, по данным на 16 мая, он выдает "всего" 3,4 петафлопс. При изучении сводной статистики проекта многих может удивить, что традиционные процессоры вносят весьма незначительную лепту - около 290 терафлопс. Зато GPU компании Nvidia суммарно выдают больше 1,3 петафлопс, а второе и третье место делят GPU ATI и PlayStation 3 (880 и 883 терафлопс соответственно). Да, архитектура x86 пока идеальна далеко не везде.

Таблица, демонстрирующая баланс сил в Folding@Home на 6 утра 16 мая 2010 года. Как видим, обычные компьютеры сильно уступают по эффективности PlayStation 3, но и консолям удается конкурировать с GPU, лишь благодаря высокой численности.

Всего с момента старта вычислений клиент Folding@Home был установлен более чем на 4,2 миллиона машин, и на сегодня данный проект является самым мощным в сфере распределенных вычислений, что подтверждает и Книга рекордов Гиннесса.
Приятно отметить, что россияне находятся в авангарде проекта, и команда TSC! Russia держит пятое место в мире по скорости и второе - по числу активных пользователей. Их конкуренты из команды Russia сейчас на 54-м месте по скорости, но учитывая, что всего команд 181 012, результат очень неплохой. Нередко, приходя в проект ради борьбы с болезнями, люди исптывают азарт и желание поднять свою команду в рейтинге, тогда как все остальное отходит на второй план. Это не страшно, потому что, какой бы ни была мотивация, все идет на пользу дела. Вот только какого дела?
⇡#Если забыть про цифры
За десять лет Folding@home существенно изменился. Остались в прошлом, прямо скажем, недостаточно качественные версии клиента, имеющие привычку рушиться и уносить с собой результаты расчетов за сутки. Нынешние версии, как для CPU, так и для GPU, довольно стабильны, и сейчас не услышишь историй, как десять crash подряд заставили пламенного альтруиста плюнуть на благо человечества и покинуть проект. Остались в прошлом и подозрения, что под видом борьбы с раком идет расчет какой-нибудь гадости, вроде нового вида бактериологического оружия: практически все данные проекта поступают в открытом виде, и если бы там пряталось что-то нехорошее, это давно бы вычислили. В конце концов, нигде нет столько параноиков, как в тусовке альтруистов.
Скорее, некоторое снижение популярности Folding@home связано с вопросом, который начинают задавать все больше людей - "А чего, собственно, удалось достигнуть за десять лет?" Оно, конечно, не жалко запустить на постоянно работающем компьютере или игровой консоли программку, пусть это и приведет к росту ежемесячного счета за электричество на 100-200 рублей за одну машину (процессоры и, тем более, видеокарты под нагрузкой "едят" драматически больше, чем в режиме uTorrent+Miranda). Но хотелось бы узреть хоть какой-то очевидный результат!

Примерно такую картинку можно увидеть на экране, если запустить клиент в графическом режиме. Чем мощнее машина, тем больше разноцветных шариков.

На официальном сайте проекта об этом говорят весьма уклончиво. Цитируем: "Мы достигли определённых успехов. Вы можете прочитать об этом на странице Наука, на нашей странице Награды, или перейти по ссылке Результаты". По линкам обнаруживается список наград за саму платформу и перечень статей, написанных по результатам вычислений. Последний кажется довольно большим, но когда вспоминаешь, что 54 работы написаны за все десять лет, начинают терзать смутные сомнения. В конце концов, зная производительность ученой братии, пять с небольшим статей в год - это негусто.
Но может быть, работы настолько глубоки, что количество не имеет никакого значения? Если вы в достаточной мере владеете научным английским и разбираетесь в биологии, можете ответить на этот вопрос сами, ознакомившись с кратким описанием каждой работы. К сожалению, автор этой статьи, не может похвастаться такими знаниями, и ему пришлось прибегнуть к консультации профессора кафедры биомедицинского инжиниринга из Ben-Gurion University of the Negev (Израиль), давшего ее на условиях анонимности. По мнению профессора, если сравнить проект с попыткой понять принцип работы автомобиля, сейчас можно было бы говорить о постижении причин, из-за которых колеса сделали круглыми, а не квадратными. Но есть еще некоторые сомнение по поводу восьмиугольников. Все же остальное, от устройства двигателя внутреннего сгорания и климат-контроля до формулы краски кузова, не изучено вообще никак. Тем не менее, профессор считает Folding@home достаточно полезным и даже рекомендует подключаться к нему своим студентам. Парадокс? Ничуть не бывало. "Folding@home сильно напоминает тыкание пальцем в небо. Но иногда в науке это срабатывает, плюс нельзя переоценить важность чувства причастности к важному делу, возникающего у молодых исследователей. Да и палец сейчас стал таким мощным, что того и глядишь, попадет в нужное место".

В современной науке еще осталось место колбочкам и пробиркам. Однако без компьютеров решить многие задачи попросту невозможно - уж слишком велик объем информации.

Справедливости ради, следует заметить, что вопросы о конкретных результатах "здесь и сейчас" обычно задают новички, плохо представляющие, как работает современная наука. Между тем, участники со стажем ощущают себя кем-то вроде старателей, помогающих ученым отгр!!!!! пустую породу. Привлекать к этой неблагодарной работе высокооплачиваемых профи (читай - суперкомпьютеры) бессмысленно, они вступят в бой, когда найдут первые золотые слитки. Но случится это (если, конечно, случится) нескоро, хотя с появлением новых мощных GPU и действительно многоядерных CPU дело может пойти поживее: уже сегодня руководители проекта обещают вскорости достичь производительности порядка 100 петафлопс. То есть число пальцев, устремленных в небо, существенно увеличится…
В текущей (6.23) версии клиента Folding@home есть возможность регулировать уровень загрузки процессора, и потому его можно без ущерба для удобства работы запускать даже на очень слабеньких системах. Работает клиент на всех популярных операционных системах, так что его можно ставить даже на продвинутые NAS. А вот ставить или нет - решайте сами. Физический износ компьютера не ускорится, но шуметь он, скорее всего, будет заметно больше, да и придется ежемесячно платить несколько сотен рублей за электричество сверх обычной суммы (чем мощнее процессор и видеокарта - тем больше). Но зато, когда рак и болезнь Альцгеймера, наконец, одолеют, вы сможете почувствовать себя одним из победителей. Ну, или ваши дети. Или внуки.
Кстати, российские суперкомпьютеры никак не войдут в мировой TOP-10, а проект Союзного государства "СКИФ-ГРИД", который должен этот вход обеспечить, еще не вышел на проектную мощность. А что если создать национальный проект распределенных вычислений и устанавливать клиент на все компьютеры, закупающиеся в рамках федеральных программ? Ну и, конечно, выложить версию с поддержкой вычислений на GPU в открытый доступ. Неужели не наберем четыре с небольшим сотни терафлопс, как у самого мощного российского суперкомпьютера "Ломоносов"? Главное - придумать - что будет полезно и важно вычислять в первую очередь. Ждем ваших идей в комментариях к этой статье.
www.Boinc.ru

Нажмите на изображение для увеличения
Название: biotechnology.jpg
Просмотров: 39
Размер:	32.5 Кб
ID:	57837

Нажмите на изображение для увеличения
Название: client_graphics.jpg
Просмотров: 53
Размер:	44.4 Кб
ID:	57838

Нажмите на изображение для увеличения
Название: FAH-tflops.jpg
Просмотров: 16
Размер:	51.1 Кб
ID:	57839

Нажмите на изображение для увеличения
Название: playstation_3.jpg
Просмотров: 32
Размер:	16.7 Кб
ID:	57840

Нажмите на изображение для увеличения
Название: table_of_clients.jpg
Просмотров: 53
Размер:	38.3 Кб
ID:	57841
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 25.07.2020, 11:11   [включить плавающее окно]   #396
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
Синтетическое соединение может быть полезным для разработки лечения вируса Зика

Синтетическое соединение может быть полезным для разработки лечения вируса Зика

Автор: исследовательская команда OpenZika
23 июля 2020 г.

Резюме
Когда исследовательская группа OpenZika завершила свою работу над World Community Grid, они определили многообещающее соединение в продолжающемся поиске методов лечения Zika.

Члены команды OpenZika Brazil (слева направо): Мелина Моттин, Каролина Андраде, Бруна Соуза и Пауло Рамос.

Члены американской команды OpenZika в Collaborations Pharmeceuticals (слева направо): доктор Шон Экинс, Дэниел Фоил, Кимберли Цорн, Ана Пул Рубио, Дженнифер Кляйн, Мэгги Хапси, Томас Лейн, Андреа Барри (бизнес-консультант)

Background

Проект OpenZika был создан для выявления потенциальных способов лечения людей, зараженных вирусом Зика. В частности, проект нацелен на ключевые белки, которые вирус использует для выживания и распространения в организме, основываясь на том, что известно о сходных заболеваниях, таких как лихорадка денге и желтая лихорадка. Чтобы разработать методы лечения, исследователи стремились определить, какие из миллионов химических соединений могут эффективно воздействовать на эти ключевые белки.

Исследователи выяснили, какие химические соединения могут быть эффективными против кристаллической структуры геликазы апо NS3 (апо означает, что белок не был связан ни с чем, например, с кофактором, ингибитором или нуклеиновой кислотой). Геликаза NS3 важна, потому что это компонент вируса Зика (ZIKV), который позволяет ему размножаться. Вы можете узнать больше о геликазах здесь.

https://www.worldcommunitygrid.org/r...ka/overview.do
https://www.nature.com/scitable/defi.../helicase-307/
Потенциальное лечение
https://www.nature.com/srep/

В конце 2019 года исследователи OpenZika опубликовали статью в Scientific Reports, в которой изложены их работы, показывающие, что синтетическое соединение под названием FAM E3 может ингибировать инфекцию ZIKV, блокируя стадию репликации генома. Благодаря работе по молекулярной стыковке с сеткой World Community Grid исследователи смогли предсказать возможное взаимодействие между FAM E3 и геликазой ZIKV NS3. Основываясь на результатах молекулярной стыковки, исследователи исследовали взаимодействие in vitro и продемонстрировали, что FAM E3 может связываться и стабилизировать NS3.

https://www.nature.com/articles/s41598-019-54169-z#Ack1
Вы можете прочитать статью здесь. Результаты могут быть полезны для дальнейшей разработки противовирусных препаратов Zika, а также для лучшего понимания того, как именно это синтетическое соединение ингибирует репликацию вируса.

Другие новости

https://www.sciencedirect.com/scienc...458?via%3Dihub

Как и многие ученые с большим опытом исследований инфекционных заболеваний, команда OpenZika в настоящее время выполняет работу, связанную с SARS-CoV-2. В мае команда опубликовала в Drug Discovery Today обзор проектов по обнаружению наркотиков для SARS-CoV-2. В этом документе упоминается, что они узнали из опыта предыдущих проектов, включая проект OpenZika.

Исследовательская группа также приступила к написанию новой статьи о результатах виртуального скрининга проекта на геликазу NS3 и протеазу NS2B-NS3, результаты которых получены in vitro на ZIKV, а также на белках.

Спасибо многим волонтерам по всему миру, которые поддержали этот проект во время работы над World Community Grid.
Миниатюры
Нажмите на изображение для увеличения
Название: OZ_Brazil_Team.jpg
Просмотров: 28
Размер:	47.7 Кб
ID:	57876   Нажмите на изображение для увеличения
Название: OZ_US_Team2.jpg
Просмотров: 59
Размер:	29.8 Кб
ID:	57877  
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Непрочитано 07.08.2020, 19:03   [включить плавающее окно]   #397
SETI_home_v8
Мужской Продвинутый
Автор темы
 
Аватар для SETI_home_v8
 
Регистрация: 11.08.2018
Адрес: Тюмень
RakeSearch: Карельский научный центр РАН и добровольные вычисления

RakeSearch: Карельский научный центр РАН и добровольные вычисления

https://rake.boincfast.ru/rakesearch/

В научной среде для разгадки сложных задач и поиска наиболее эффективных решений принято объединяться, так как вместе гораздо легче и быстрее можно найти ответы на интересующие общество вопросы. И с развитием технологий люди “научили” свои компьютеры такому же принципу. С 90-х годов прошлого века стали очень популярны вычислительные системы на основе добровольных вычислений (Volunteer computing), когда объединяются не только люди, но также вычислительные ресурсы их компьютеров. В результате, одновременно множество персональных компьютеров с разных уголков нашей планеты выполняют вычисления по выбранной задаче в фоновом режиме. Сформировалось целое направление Desktop Grid.

“Desktop Grid — это объединение в качестве единого логического «суперкомпьютера» большого количества неспециализированных вычислителей (офисных рабочих и персональных компьютеров, ноутбуков и даже смартфонов) относительно невысокой производительности.”

На сегодняшний день, добровольные вычисления используются в поиске лекарства от коронавируса - это огромные вычислительные мощности. Широко известны проекты PrimeGrid, занимающийся поиском простых чисел, SETI@Home, в котором в течение 20 лет проводился поиск космических радиосигналов внеземного происхождения, и Folding@Home, проект моделирования свёртывания молекул белка.

На базе Карельского научного центра РАН в Институте прикладных математических исследований уже порядка 10 лет занимаются развитием технологии Desktop Grid. В частности, ученые уже реализовали проект по поиску компонентов для лекарственного препарата от Пемфигуса (пузырчатка обыкновенная - тяжелое аутоимунное заболевание), используя добровольные вычисления. На данный момент, научная команда института работает над проектом RakeSearch, призванном решать математические задачи. Уже в феврале этого года CNews сообщил об итогах сравнительного тестирования производительности процессоров «Эльбрус-8C» и различных моделей Intel и AMD, для исследования которых были использованы ресурсы тематического проекта RakeSearch.

Мы решили узнать у соавтора проекта RakeSearch Наталии Никитиной о том, как родилась идея проекта и поделится опытом добровольных вычислений в различных областях науки.

"Институт прикладных математических исследований КарНЦ РАН интересует приложение технологии Desktop Grid к решению междисциплинарных научных задач. Именно с этой целью создавался проект RakeSearch, соавтором которого я являюсь”

Что такое латинский квадрат?

Латинский квадрат – это математический объект, представляющий собой таблицу размером n*n, заполненную n элементами множества M так, что в каждой строке и каждом столбце каждый элемент из M встречается точно 1 раз.

Диагональный латинский квадрат – это латинский квадрат, в котором элементы на главной и побочной диагонали не повторяются.

Латинский Квадрат

“Наши коллеги из Юго-Западного государственного университета (Курск) уже давно исследуют квадраты на базе проекта добровольных вычислений Gerasim@home. Как побочная ветвь исследований возникла идея поиска строчно-перестановочных пар ОДЛК (Ортогональных диагональных латинских квадратов). Идея принадлежит Максиму М. из Москвы, который увлекается квадратами в качестве хобби. Идея оказалась достаточно оригинальной, чтобы запустить отдельный проект RakeSearch. Это проект добровольных вычислений. Латинские квадраты - это лишь пример исследования. Аналогично наша группа могла бы содействовать поиску лекарств, например, у нас уже есть один реализованный проект в данном направлении, он также был на основе добровольных вычислений. По сути, тематика проектов добровольных вычислений не ограничивается медициной и математикой, это может быть любая вычислительная задача, которая поддается разделению на множество независимых подзадач”.

Расскажите о Вашем опыте совместной работы с научными командами в сфере добровольных вычислений?

“Мы стараемся создавать проекты на основе контактов с научными группами. В случае с поиском компонента лекарства от Пузырчатки обыкновенной - с немецкой группой. Этот контакт закрепился, когда я была на стажировке в Германии по программе DAAD. В случае исследования квадратов - с российскими учёными из ЮЗГУ (Курск). Для RakeSearch КарНЦ РАН выделил нам сервер, и далее мы создали проект RakeSearch, который был запущен в августе 2017 года. В основе лежит известная программная платформа BOINC. Существует много проектов в мире на основе этой платформы. Сейчас и наша группа вносит определенный вклад в её популяризацию, оптимизацию и развитие. На протяжении всей работы проекта росло количество участников проекта. Все они - это члены сообщества добровольных вычислений, которых привлекла тематика проекта или желание помочь. Кроме того, вычислительные ресурсы, пожертвованные нашему проекту, учитываются в общем рейтинге сообщества добровольных вычислений. Поскольку проект занял своё место среди других BOINC-проектов по всему миру, то и участники появились из разных городов и стран”.

RakeSearch, аналогично любому научному вычислительному проекту, способен небольшими усилиями привлечь вычислительные мощности множество людей по всему миру.

“Например, если бы какая-то научная группа биологов КарНЦ РАН захотела провести виртуальный скрининг для поиска лекарства от клещевого энцефалита или любой другой болезни, то за считанные недели можно было бы привлечь десятки и сотни компьютеров, готовых работать на протяжении нескольких месяцев или лет по заданной тематике. Это похоже на целый суперкомпьютер, который предоставлен совершенно бесплатно энтузиастами. Конечно, для этого нужно опубликовать научную цель проекта, держать участников в курсе прогресса исследований и рассказывать о промежуточных результатах. Возможно также создание локальной Desktop Grid в рамках одной организации”.

В каком направлении сейчас идут исследования в RakeSearch?

«Сейчас в проекте RakeSearch исследуются свойства латинских квадратов для приложений в области информационной безопасности и криптографии. Эту научную задачу поставил Олег Заикин, ведущий научный сотрудник Института динамики систем и теории управления им. В.М. Матросова СО РАН, г. Иркутск.


Какие есть промежуточные результаты проекта RakeSearch?

“В проекте RakeSearch промежуточные результаты представляют собой пары ОДЛК (ортогональных диагональных латинских квадратов) и графы ОДЛК, которые выглядят для сторонних наблюдателей очень красиво”.

Полный список находок проекта можно посмотреть в виде графов (https://rake.boincfast.ru/rakesearch/graphs.html ) и пар ОДЛК (https://rake.boincfast.ru/rakesearch/odls_results.php).
Нажмите на изображение для увеличения
Название: 5yhDRv-0ITc.jpg
Просмотров: 9
Размер:	43.0 Кб
ID:	57941

Нажмите на изображение для увеличения
Название: CFl82RXJsws.jpg
Просмотров: 8
Размер:	233.3 Кб
ID:	57942

Нажмите на изображение для увеличения
Название: e16FgqsFrKs.jpg
Просмотров: 9
Размер:	13.1 Кб
ID:	57943

Нажмите на изображение для увеличения
Название: gnWQVNCJ6Ec.jpg
Просмотров: 10
Размер:	93.0 Кб
ID:	57944

Нажмите на изображение для увеличения
Название: GolRxco_mrQ.jpg
Просмотров: 10
Размер:	49.6 Кб
ID:	57945
__________________
www.Boinc.ru распределенные вычисления на благо науки!
SETI_home_v8 вне форума  
Конфигурация ПК
Ответить с цитированием
Ответ Создать новую тему

Опции темы
Опции просмотра

Ваши права в разделе
Вы не можете создавать новые темы
Вы не можете отвечать в темах
Вы не можете прикреплять вложения
Вы не можете редактировать свои сообщения

BB коды Вкл.
Смайлы Вкл.
[IMG] код Вкл.
HTML код Выкл.

Быстрый переход


Текущее время: 08:55. Часовой пояс GMT +3.


Powered by vBulletin® Version 3.8.4
Copyright ©2000 - 2020, Jelsoft Enterprises Ltd. Перевод: zCarot
Copyright © 2000-2017 3DNews. All Rights Reserved.
Администрация 3DNews требует соблюдения на форуме правил и законов РФ
Серверы размещены в Hostkey